124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_23190 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  73.6 
 
 
178 aa  274  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  73.03 
 
 
178 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  77.22 
 
 
178 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  77.85 
 
 
184 aa  254  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  77.85 
 
 
178 aa  253  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  70.22 
 
 
178 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  73.01 
 
 
183 aa  249  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  66.48 
 
 
179 aa  248  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  65.17 
 
 
177 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  74.05 
 
 
178 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  54.25 
 
 
167 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  51.32 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  51.32 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  51.32 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  50.66 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  49.35 
 
 
169 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  49.35 
 
 
234 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  48.41 
 
 
170 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  49.02 
 
 
167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  47.06 
 
 
167 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  40.43 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0099  hypothetical protein  37.5 
 
 
175 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  37.5 
 
 
175 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  38.41 
 
 
156 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  37.84 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  35.19 
 
 
277 aa  93.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  39.62 
 
 
174 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  35.57 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  42.34 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  37.91 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  36.73 
 
 
247 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  36.05 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  36.05 
 
 
247 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  36.05 
 
 
247 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  36.05 
 
 
247 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  34.42 
 
 
247 aa  85.1  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  34 
 
 
267 aa  84.7  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  38.78 
 
 
248 aa  84.7  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  33.57 
 
 
227 aa  84  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  36.49 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  35.37 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  37.16 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  37.59 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  35.81 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  36.49 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  35.1 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  35.37 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  38.36 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  32.17 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  37.84 
 
 
159 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  35.57 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  34.69 
 
 
274 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  35.37 
 
 
256 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  38.78 
 
 
248 aa  81.3  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  36.81 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  34.25 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  33.33 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  34.69 
 
 
251 aa  79  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  34.48 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  34 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  36.43 
 
 
268 aa  78.2  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  35.14 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  32.64 
 
 
222 aa  77  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  39.34 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  33.79 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  33.56 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  33.77 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  33.57 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  32 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  35.43 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  30.67 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  36.73 
 
 
157 aa  72  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  30.61 
 
 
160 aa  72  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  33.56 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  33.8 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  30.07 
 
 
458 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  31.58 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  31.68 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  32.77 
 
 
627 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  32.43 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  31.47 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  31.47 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  32.77 
 
 
626 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  30.32 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  29.22 
 
 
455 aa  65.5  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2978  hypothetical protein  40.71 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148956  normal  0.0419539 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  30.14 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1706  hypothetical protein  29.24 
 
 
294 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2309  hypothetical protein  32.67 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  31.51 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  31.51 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  30.14 
 
 
142 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  33.79 
 
 
456 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  30.07 
 
 
165 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2354  hypothetical protein  28.39 
 
 
163 aa  61.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00335238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  33.8 
 
 
145 aa  60.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2641  hypothetical protein  31.47 
 
 
143 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>