87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2978 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2978  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148956  normal  0.0419539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  62.89 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  53.66 
 
 		 174 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  53.66 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  41.05 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  36.21 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  44.44 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  37.07 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  38.95 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  38.95 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  39.58 
 
 		 167 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  36.46 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  40.71 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  38.27 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  42.39 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  34.19 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  40.24 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  41.3 
 
 		 178 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  37.93 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  41.3 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  37.17 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  41.3 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  33.05 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  37.93 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  44.74 
 
 		 308 aa  60.5  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  41.98 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  39.51 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  34.74 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  34.74 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  37.66 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  37.97 
 
 		 268 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  35.4 
 
 		 183 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  38.96 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  40.51 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  40.51 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  35.96 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  34.51 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  38.96 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  40.79 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  39.51 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  36.59 
 
 		 227 aa  53.9  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  39.74 
 
 		 257 aa  53.9  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  39.74 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  38.46 
 
 		 248 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  40.26 
 
 		 248 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  35.9 
 
 		 247 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  35.9 
 
 		 247 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 245 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  35.9 
 
 		 247 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  38.96 
 
 		 251 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  35.9 
 
 		 247 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  35.06 
 
 		 254 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  39.29 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  35.06 
 
 		 273 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 222 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  35.06 
 
 		 274 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  33.77 
 
 		 274 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  32.53 
 
 		 266 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  36.05 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  34.88 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  55.56 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  55.56 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  55.56 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  52.78 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  38.46 
 
 		 626 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  32.94 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  35.44 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  39.47 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  50 
 
 		 206 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  28.05 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  32.88 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  35.62 
 
 		 146 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  36.36 
 
 		 149 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1211  hypothetical protein  34.15 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  31.71 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  44.44 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  34.62 
 
 		 627 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  44.12 
 
 		 149 aa  40  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  29.27 
 
 		 145 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>