124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2034 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  100 
 
 		 145 aa  299  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  64.75 
 
 		 141 aa  207  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  60.71 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  58.45 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  56.74 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  52.48 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  53.79 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  49.64 
 
 		 458 aa  147  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  48.57 
 
 		 455 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  51.82 
 
 		 456 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  50 
 
 		 459 aa  140  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  45 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  44.12 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  44.93 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  43.57 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  44.6 
 
 		 471 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2265  hypothetical protein  45.26 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0387  hypothetical protein  44.85 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  45.19 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2354  hypothetical protein  43.88 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00335238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  46.62 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  43.7 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2309  hypothetical protein  41.91 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  42.65 
 
 		 471 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  43.7 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  41.48 
 
 		 165 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  42.96 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  42.96 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  41.48 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  42.96 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  43.7 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  40.71 
 
 		 179 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  40.71 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  40.71 
 
 		 206 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  40.71 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  38.81 
 
 		 148 aa  104  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  40.3 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1211  hypothetical protein  41.48 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1550  hypothetical protein  35.71 
 
 		 164 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2641  hypothetical protein  35.82 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  35 
 
 		 176 aa  97.4  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1686  hypothetical protein  37.76 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  39.67 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  35.97 
 
 		 189 aa  83.6  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6088  protein of unknown function DUF785  35.46 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  33.56 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  32.62 
 
 		 268 aa  77.4  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02455  hypothetical protein  34.07 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  31.03 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  36.72 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 256 aa  74.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  30.37 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  32.09 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  35.07 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3273  protein of unknown function DUF785  30.28 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  34.93 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  32.67 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  30.88 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  33.8 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  30.88 
 
 		 247 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  30.15 
 
 		 247 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  30.15 
 
 		 247 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  30.15 
 
 		 247 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  31.54 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  32.17 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  34.06 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  32.48 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  35.62 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  32.48 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  32.48 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  35.62 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  32.39 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  31.21 
 
 		 274 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  32.48 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  34.75 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  33.82 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  30.5 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  30.5 
 
 		 273 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  34.62 
 
 		 308 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  32.39 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  33.33 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  34.48 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  29.41 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  32.39 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  30.5 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  33.1 
 
 		 167 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  34.27 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  33.57 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  32.14 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  34.48 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  34.51 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  30.66 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  36.07 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  33.8 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  31.97 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  28.57 
 
 		 627 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>