124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2265 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2265  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0387  hypothetical protein  61.48 
 
 
161 aa  169  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2354  hypothetical protein  56 
 
 
163 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00335238  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  54.55 
 
 
160 aa  159  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  56.43 
 
 
146 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  52.41 
 
 
455 aa  158  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1550  hypothetical protein  55.07 
 
 
164 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2309  hypothetical protein  56.3 
 
 
152 aa  154  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  50.7 
 
 
147 aa  153  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  48.28 
 
 
160 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  52.17 
 
 
157 aa  147  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  48.57 
 
 
456 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  48.57 
 
 
148 aa  144  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  53.33 
 
 
153 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  53.33 
 
 
153 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  55.56 
 
 
154 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  46.76 
 
 
458 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  48.59 
 
 
146 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  50.68 
 
 
165 aa  140  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  47.86 
 
 
459 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  52.59 
 
 
149 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  43.04 
 
 
471 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2641  hypothetical protein  45.93 
 
 
143 aa  130  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1211  hypothetical protein  48.91 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  49.3 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  45.26 
 
 
145 aa  124  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  45.26 
 
 
141 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  47.06 
 
 
471 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  43.07 
 
 
142 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  43.8 
 
 
142 aa  117  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  41.61 
 
 
151 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  42.54 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  41.79 
 
 
179 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  41.79 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  41.79 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  41.79 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  42.96 
 
 
149 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  41.79 
 
 
156 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  42.54 
 
 
148 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  41.04 
 
 
179 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  41.91 
 
 
144 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  41.79 
 
 
159 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  40.3 
 
 
166 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  38.14 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  32.58 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  33.77 
 
 
227 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6088  protein of unknown function DUF785  32.09 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3273  protein of unknown function DUF785  32.65 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  31.85 
 
 
227 aa  70.9  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  70.5  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  33.81 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  31.16 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  30.99 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  30.61 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  31.97 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  32 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  34.97 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  43.12 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  31.9 
 
 
268 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1686  hypothetical protein  29.2 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  29.45 
 
 
277 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  28.06 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02455  hypothetical protein  27.74 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  28.99 
 
 
194 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  32.68 
 
 
183 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  29.93 
 
 
166 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  29.8 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  33.12 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  29.8 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  33.12 
 
 
184 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  28.77 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  32.84 
 
 
248 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  31.3 
 
 
245 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  30.67 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  32.47 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  31.54 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  27.54 
 
 
254 aa  58.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  31.16 
 
 
248 aa  58.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  31.5 
 
 
172 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  32.47 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  32.03 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  31.06 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  30.87 
 
 
234 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  33.85 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  29.1 
 
 
245 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  29.93 
 
 
251 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  29.85 
 
 
248 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  28.67 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  31.25 
 
 
247 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  27.52 
 
 
247 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  29.92 
 
 
247 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  29.92 
 
 
247 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2064  hypothetical protein  30 
 
 
289 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1956  hypothetical protein  28.95 
 
 
289 aa  52.4  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221444  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  27.52 
 
 
247 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  30 
 
 
174 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2601  hypothetical protein  27.5 
 
 
289 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  29.09 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1564  hypothetical protein  32.17 
 
 
321 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>