116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0387 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0387  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  334  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  57.64 
 
 
147 aa  174  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  59.26 
 
 
160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2354  hypothetical protein  62.4 
 
 
163 aa  170  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00335238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2265  hypothetical protein  61.48 
 
 
161 aa  169  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2309  hypothetical protein  57.78 
 
 
152 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  52.82 
 
 
146 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1550  hypothetical protein  62.5 
 
 
164 aa  161  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  51.72 
 
 
146 aa  158  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  56.39 
 
 
149 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  49.64 
 
 
471 aa  154  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  48.32 
 
 
153 aa  153  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  48.32 
 
 
153 aa  153  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  55.64 
 
 
154 aa  153  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  49.65 
 
 
455 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  55.22 
 
 
165 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  51.09 
 
 
148 aa  149  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  47.48 
 
 
458 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2641  hypothetical protein  53.38 
 
 
143 aa  142  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  47.55 
 
 
471 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1211  hypothetical protein  52.63 
 
 
143 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  42.14 
 
 
456 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  42.14 
 
 
459 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  45.04 
 
 
160 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  44.6 
 
 
151 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  44.85 
 
 
145 aa  124  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  46.27 
 
 
176 aa  123  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  43.57 
 
 
141 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  41.78 
 
 
158 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  40.69 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  40.13 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  40 
 
 
206 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  40.71 
 
 
142 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  41.79 
 
 
179 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  40.71 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  41.04 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  41.79 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  40.88 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  40.58 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  39.58 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  35.14 
 
 
199 aa  95.5  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  38.84 
 
 
144 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  37.88 
 
 
149 aa  88.2  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  46.32 
 
 
145 aa  87  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  32.45 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6088  protein of unknown function DUF785  36.89 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  31.79 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02455  hypothetical protein  32.77 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  30.28 
 
 
180 aa  67.4  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  34.04 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  34.04 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  30.46 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  31.03 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  31.03 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  33.8 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  27.34 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  32.33 
 
 
227 aa  60.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  31.54 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  28.38 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  30.71 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  28.38 
 
 
234 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  33.81 
 
 
308 aa  58.9  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  28.95 
 
 
167 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  29.71 
 
 
227 aa  58.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  32.5 
 
 
167 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  28.47 
 
 
167 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1686  hypothetical protein  29.2 
 
 
141 aa  58.2  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  33.83 
 
 
254 aa  57.4  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  33.33 
 
 
172 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  28.1 
 
 
266 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  35.48 
 
 
248 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  29.1 
 
 
267 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  26.12 
 
 
268 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  32.84 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  34.06 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  32.11 
 
 
194 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  29.5 
 
 
277 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3273  protein of unknown function DUF785  29.77 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  31.2 
 
 
251 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  29.79 
 
 
178 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  28.1 
 
 
256 aa  53.9  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  30.71 
 
 
245 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  32.76 
 
 
245 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  32.79 
 
 
248 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  27.34 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  35.29 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  35.29 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  28.47 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  29.73 
 
 
178 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  28.47 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  28.48 
 
 
175 aa  50.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2273  hypothetical protein  30.91 
 
 
316 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047797  n/a   
 
 
 
NC_006368  lpp0099  hypothetical protein  27.71 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  30.28 
 
 
274 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  28.44 
 
 
273 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>