More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000230 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05968  glycine cleavage system protein T2  93.82 
 
 		 376 aa  718    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000230  aminomethyltransferase (glycine cleavage system T protein)  100 
 
 		 372 aa  753    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0496  glycine cleavage system T protein  82.8 
 
 		 372 aa  633  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0949  glycine cleavage system T protein  81.89 
 
 		 376 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3841  glycine cleavage system T protein  71.7 
 
 		 375 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2726  glycine cleavage system T protein  72.58 
 
 		 376 aa  560  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1343  glycine cleavage system T protein  67.56 
 
 		 374 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  67.11 
 
 		 373 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  65.78 
 
 		 373 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  66.31 
 
 		 373 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  65.68 
 
 		 374 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  65.24 
 
 		 373 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  65.15 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  65.78 
 
 		 373 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  65.42 
 
 		 374 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  64.88 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1815  glycine cleavage system T protein  63.17 
 
 		 379 aa  477  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.863047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  66.04 
 
 		 373 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.03 
 
 		 379 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  61.56 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  61.56 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4373  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.54 
 
 		 382 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520618  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1868  glycine cleavage system T protein  57.78 
 
 		 398 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0707876  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.5 
 
 		 384 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3738  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.5 
 
 		 382 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0571205  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  57.8 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2091  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.62 
 
 		 378 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3957  glycine cleavage system T protein  59.08 
 
 		 408 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0748489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1561  glycine cleavage system T protein  58.27 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.43 
 
 		 382 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2282  glycine cleavage system T protein  60.66 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.88282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2683  glycine cleavage system T protein  59.89 
 
 		 384 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.837498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1184  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.02 
 
 		 379 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394661  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1286  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  59.63 
 
 		 383 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.846982  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1889  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.09 
 
 		 378 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163517  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  59.37 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3145  glycine cleavage system T protein  61.25 
 
 		 376 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  60.27 
 
 		 380 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1570  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.62 
 
 		 384 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000466042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3299  glycine cleavage system T protein  57.85 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1433  aminomethyltransferase  57.84 
 
 		 381 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2393  glycine cleavage system T protein  58.67 
 
 		 374 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.673157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  57.84 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4268  glycine cleavage system T protein  55.82 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2193  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.82 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.82 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  57.71 
 
 		 384 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.87 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.75 
 
 		 377 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0534  glycine cleavage system T protein  58.47 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0779  glycine cleavage system T protein  57.18 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678322  normal  0.0882666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2211  glycine cleavage system T protein  56.3 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0855  glycine cleavage system T protein  60 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0510506  normal  0.0771176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3620  glycine cleavage system T protein  55.28 
 
 		 366 aa  378  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3019  glycine cleavage system T protein  58.24 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0814  glycine cleavage system T protein  59.73 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327481  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.43 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6035  glycine cleavage system T protein  56.27 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  53.68 
 
 		 366 aa  362  8e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  53.24 
 
 		 370 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  53.44 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0727  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.07 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3864  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.06 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.782346  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1217  glycine cleavage system T protein  52.01 
 
 		 377 aa  332  6e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104927 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0681  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.54 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.46 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2694  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.52 
 
 		 377 aa  323  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3526  glycine cleavage system T protein  57.41 
 
 		 380 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1096  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.65 
 
 		 373 aa  318  9e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184957  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2682  aminomethyltransferase, glycine cleavage system T protein  50.68 
 
 		 361 aa  303  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.82644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1018  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.16 
 
 		 364 aa  301  9e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26241  predicted protein  45.5 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04350  aminomethyltransferase, mitochondrial precursor, putative  42.38 
 
 		 409 aa  275  7e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.716927  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83560  Aminomethyl transferase  41.15 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.82 
 
 		 369 aa  259  7e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.37 
 
 		 372 aa  252  8.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  43.6 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.49 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01198  hypothetical glycine cleavage system T protein (Eurofung)  37.81 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  38.73 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.8 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.01 
 
 		 376 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.45 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.04 
 
 		 360 aa  236  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  39.25 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.57 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  38.71 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  37.87 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0341  glycine cleavage system T protein  44.21 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  37.43 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.61 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.54 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  39.18 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  38.44 
 
 		 362 aa  228  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.38 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  39.73 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  39.11 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.54 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1996  glycine cleavage system T protein  40.59 
 
 		 367 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.672194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  38.81 
 
 		 361 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>