More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1996 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1996  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 367 aa  761    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.672194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1403  glycine cleavage system T protein  65.93 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  66.11 
 
 		 360 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0341  glycine cleavage system T protein  66.2 
 
 		 362 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0786  glycine cleavage system T protein  59.32 
 
 		 360 aa  441  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1559  glycine cleavage system T protein  58.06 
 
 		 359 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  47.11 
 
 		 366 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  44.9 
 
 		 363 aa  315  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  44.35 
 
 		 362 aa  305  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0375  glycine cleavage system T protein  45.28 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0389  glycine cleavage system T protein  44.66 
 
 		 363 aa  301  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.65951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0395  glycine cleavage system T protein  44.63 
 
 		 363 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  44.6 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  40.9 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  39.12 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.2 
 
 		 441 aa  255  7e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  37.05 
 
 		 360 aa  255  9e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  38.61 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.78 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.57 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  37.74 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  42.53 
 
 		 366 aa  248  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  40.34 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.07 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.83 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.14 
 
 		 376 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.89 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.36 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.77 
 
 		 359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.98 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.19 
 
 		 364 aa  245  8e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.1 
 
 		 360 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.71 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.26 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.78 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.26 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  35.18 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.99 
 
 		 366 aa  242  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  39.06 
 
 		 363 aa  242  9e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  39.41 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.99 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.99 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.99 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.99 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.99 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.44 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  39.51 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.09 
 
 		 368 aa  238  9e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  40.11 
 
 		 373 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  38.74 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  38.72 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.67 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  37.95 
 
 		 364 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  38.63 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.78 
 
 		 370 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  39.01 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.22 
 
 		 365 aa  232  6e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.74 
 
 		 381 aa  233  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.71 
 
 		 430 aa  232  7.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.25 
 
 		 360 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.44 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.25 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.46 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18781  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.68 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.81 
 
 		 363 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.81 
 
 		 363 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.24 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.97 
 
 		 360 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.24 
 
 		 374 aa  229  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.28 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  34.9 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  38.58 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000230  aminomethyltransferase (glycine cleavage system T protein)  40.59 
 
 		 372 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05968  glycine cleavage system protein T2  40 
 
 		 376 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  39.88 
 
 		 409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.05 
 
 		 366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  38.63 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  38.72 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.31 
 
 		 359 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  39.21 
 
 		 370 aa  225  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  37.92 
 
 		 369 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  40.44 
 
 		 384 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.55 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4373  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.74 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  39.35 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.83 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.7 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.81 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.7 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.57 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.19 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  38.51 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.11 
 
 		 362 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.6 
 
 		 365 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  38.1 
 
 		 351 aa  222  9e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  38.08 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  38.1 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>