More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3051 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 		 375 aa  750    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  60.95 
 
 		 380 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  60.05 
 
 		 373 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  61.5 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  58.6 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  59.03 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  59.21 
 
 		 379 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  59.95 
 
 		 373 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  59.14 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05968  glycine cleavage system protein T2  58.06 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  58.87 
 
 		 373 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  59.51 
 
 		 373 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  58.54 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1889  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.26 
 
 		 378 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163517  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  56.73 
 
 		 409 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2091  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.52 
 
 		 378 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4373  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  59.47 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1561  glycine cleavage system T protein  57.57 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000230  aminomethyltransferase (glycine cleavage system T protein)  56.87 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  57.3 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1184  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.87 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394661  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  57.3 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3738  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.05 
 
 		 382 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0571205  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.26 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  58.06 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3841  glycine cleavage system T protein  53.87 
 
 		 375 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3145  glycine cleavage system T protein  57.98 
 
 		 376 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2683  glycine cleavage system T protein  56.57 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.837498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1343  glycine cleavage system T protein  56.45 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2726  glycine cleavage system T protein  56.64 
 
 		 376 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0496  glycine cleavage system T protein  54.74 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1286  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.99 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.846982  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  58.51 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1868  glycine cleavage system T protein  53.85 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0707876  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0949  glycine cleavage system T protein  56.8 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1433  aminomethyltransferase  55.05 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  55.23 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.73 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.15 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3957  glycine cleavage system T protein  55.41 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0748489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2193  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.35 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.35 
 
 		 377 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2211  glycine cleavage system T protein  53.95 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1570  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.68 
 
 		 384 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000466042 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.15 
 
 		 377 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  55.8 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  54.64 
 
 		 370 aa  358  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1217  glycine cleavage system T protein  56.83 
 
 		 377 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.55 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  54.12 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3299  glycine cleavage system T protein  52.76 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4268  glycine cleavage system T protein  52.39 
 
 		 380 aa  345  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1815  glycine cleavage system T protein  52.56 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.863047  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2393  glycine cleavage system T protein  53.23 
 
 		 374 aa  343  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.673157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6035  glycine cleavage system T protein  55.59 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3019  glycine cleavage system T protein  53.33 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2282  glycine cleavage system T protein  51.1 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.88282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.19 
 
 		 388 aa  338  7e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0779  glycine cleavage system T protein  54.92 
 
 		 392 aa  338  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678322  normal  0.0882666 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0534  glycine cleavage system T protein  55.03 
 
 		 377 aa  338  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3864  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.41 
 
 		 367 aa  335  7.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.782346  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0855  glycine cleavage system T protein  55.21 
 
 		 392 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0510506  normal  0.0771176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2682  aminomethyltransferase, glycine cleavage system T protein  54.55 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.82644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0814  glycine cleavage system T protein  55.47 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327481  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2694  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.89 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0727  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.19 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0681  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.92 
 
 		 367 aa  328  7e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3620  glycine cleavage system T protein  51.61 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1096  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.96 
 
 		 373 aa  319  6e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1018  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.5 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26241  predicted protein  47.2 
 
 		 414 aa  306  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3526  glycine cleavage system T protein  57.22 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04350  aminomethyltransferase, mitochondrial precursor, putative  45.81 
 
 		 409 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.716927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.55 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.89 
 
 		 374 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.84 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.84 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.84 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  41.35 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.84 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.56 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83560  Aminomethyl transferase  37.63 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  40.31 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 		 381 aa  246  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.8 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.84 
 
 		 369 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.9 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  38.32 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  42.82 
 
 		 375 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  40.87 
 
 		 378 aa  242  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.13 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.13 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  38.33 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.93 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  42.66 
 
 		 360 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  38.16 
 
 		 357 aa  239  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  41.24 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  42.23 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  41.53 
 
 		 351 aa  235  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.12 
 
 		 375 aa  235  9e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>