More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0855 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0814  glycine cleavage system T protein  97.19 
 
 		 392 aa  657    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327481  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0855  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 392 aa  754    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0510506  normal  0.0771176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0779  glycine cleavage system T protein  87.5 
 
 		 392 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678322  normal  0.0882666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4373  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.22 
 
 		 382 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520618  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1889  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.9 
 
 		 378 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163517  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2091  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.1 
 
 		 378 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.56 
 
 		 384 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6035  glycine cleavage system T protein  70.42 
 
 		 380 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.05 
 
 		 379 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3738  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.2 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0571205  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.73 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.13 
 
 		 387 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723708  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1286  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.73 
 
 		 383 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.846982  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1184  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  59.89 
 
 		 379 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394661  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1570  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.5 
 
 		 384 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000466042 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4268  glycine cleavage system T protein  60.27 
 
 		 380 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000230  aminomethyltransferase (glycine cleavage system T protein)  60 
 
 		 372 aa  428  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05968  glycine cleavage system protein T2  59.47 
 
 		 376 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  59.06 
 
 		 374 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  58.79 
 
 		 374 aa  421  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  60.26 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  58.84 
 
 		 373 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1343  glycine cleavage system T protein  57.22 
 
 		 374 aa  418  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  58.79 
 
 		 374 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  60.26 
 
 		 373 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0949  glycine cleavage system T protein  59.42 
 
 		 376 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2726  glycine cleavage system T protein  57.14 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  58.01 
 
 		 409 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2193  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.73 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.73 
 
 		 377 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  57.26 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  58.05 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  57.26 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3841  glycine cleavage system T protein  53.56 
 
 		 375 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0496  glycine cleavage system T protein  55.56 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3526  glycine cleavage system T protein  70.26 
 
 		 380 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0534  glycine cleavage system T protein  62.03 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  59.3 
 
 		 370 aa  398  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.05 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2393  glycine cleavage system T protein  56.95 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.673157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3620  glycine cleavage system T protein  57.1 
 
 		 366 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1561  glycine cleavage system T protein  53.95 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  55.91 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1868  glycine cleavage system T protein  50.76 
 
 		 398 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0707876  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1815  glycine cleavage system T protein  53.3 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.863047  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3957  glycine cleavage system T protein  53.85 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0748489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  53.85 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.35 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  53.85 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  54.68 
 
 		 384 aa  363  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2683  glycine cleavage system T protein  53.54 
 
 		 384 aa  362  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.837498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2282  glycine cleavage system T protein  51.21 
 
 		 366 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.88282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  55.38 
 
 		 381 aa  352  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.23 
 
 		 374 aa  352  5e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1433  aminomethyltransferase  53.79 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  53.89 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3145  glycine cleavage system T protein  56.23 
 
 		 376 aa  349  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  51.84 
 
 		 391 aa  345  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3299  glycine cleavage system T protein  52.7 
 
 		 392 aa  345  8.999999999999999e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2211  glycine cleavage system T protein  50.53 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2694  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.82 
 
 		 377 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1217  glycine cleavage system T protein  52.24 
 
 		 377 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3019  glycine cleavage system T protein  52.22 
 
 		 403 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2682  aminomethyltransferase, glycine cleavage system T protein  53.49 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.82644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3864  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.27 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.782346  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1096  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.94 
 
 		 373 aa  312  5.999999999999999e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184957  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.95 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0727  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.47 
 
 		 367 aa  305  9.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0681  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.2 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1018  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.4 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  46.97 
 
 		 370 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  37.67 
 
 		 360 aa  256  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26241  predicted protein  40.36 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  40 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04350  aminomethyltransferase, mitochondrial precursor, putative  38.76 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.716927  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  40.26 
 
 		 360 aa  236  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  40.6 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.74 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  38.8 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.27 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  37.27 
 
 		 363 aa  223  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.34 
 
 		 365 aa  222  7e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  37.2 
 
 		 375 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.39 
 
 		 359 aa  222  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  39.63 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  38.32 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  35.75 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83560  Aminomethyl transferase  35.88 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.68 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0375  glycine cleavage system T protein  39.27 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.32 
 
 		 364 aa  217  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  41.52 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.89 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.73 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.47 
 
 		 360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.65 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.92 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0786  glycine cleavage system T protein  42.94 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.91 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  38.85 
 
 		 363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>