More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3620 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3620  glycine cleavage system T protein  100 
 
 		 366 aa  726    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2393  glycine cleavage system T protein  60.48 
 
 		 374 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.673157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  60.05 
 
 		 370 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.18 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2282  glycine cleavage system T protein  57.34 
 
 		 366 aa  408  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.88282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  56.53 
 
 		 409 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2193  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.75 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.64 
 
 		 384 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4373  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.76 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520618  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.48 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  55.73 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3738  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.3 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0571205  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.44 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  55.2 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2091  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.3 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  59.79 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1286  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.91 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.846982  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  55.2 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  56 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1570  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.73 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000466042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1184  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.76 
 
 		 379 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394661  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000230  aminomethyltransferase (glycine cleavage system T protein)  55.28 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1889  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.49 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163517  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3841  glycine cleavage system T protein  54.42 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0496  glycine cleavage system T protein  52.57 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  55.41 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2726  glycine cleavage system T protein  53.78 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  55.05 
 
 		 374 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1343  glycine cleavage system T protein  54.67 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05968  glycine cleavage system protein T2  54.2 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1561  glycine cleavage system T protein  54.69 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.89 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0949  glycine cleavage system T protein  55.68 
 
 		 376 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4268  glycine cleavage system T protein  53.48 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  54.26 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  54.62 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1815  glycine cleavage system T protein  52.42 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.863047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  53.91 
 
 		 391 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  53.97 
 
 		 373 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.83 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  53.33 
 
 		 380 aa  349  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0779  glycine cleavage system T protein  55.08 
 
 		 392 aa  349  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678322  normal  0.0882666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1433  aminomethyltransferase  53.91 
 
 		 381 aa  349  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0855  glycine cleavage system T protein  56.03 
 
 		 392 aa  345  7e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0510506  normal  0.0771176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0814  glycine cleavage system T protein  56.03 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327481  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1868  glycine cleavage system T protein  51.05 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0707876  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3957  glycine cleavage system T protein  51.75 
 
 		 408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0748489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6035  glycine cleavage system T protein  54.59 
 
 		 380 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0534  glycine cleavage system T protein  53.26 
 
 		 377 aa  332  5e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  51.73 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  51.73 
 
 		 376 aa  331  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.61 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3145  glycine cleavage system T protein  53.51 
 
 		 376 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  51.19 
 
 		 370 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  52.59 
 
 		 384 aa  322  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2683  glycine cleavage system T protein  52.8 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.837498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  50.53 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3864  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.79 
 
 		 367 aa  312  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.782346  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2211  glycine cleavage system T protein  50.54 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2694  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  50.54 
 
 		 377 aa  309  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0727  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.47 
 
 		 367 aa  308  8e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0681  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.2 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  50.93 
 
 		 381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2682  aminomethyltransferase, glycine cleavage system T protein  53.41 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.82644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.9 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3299  glycine cleavage system T protein  50.39 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1217  glycine cleavage system T protein  49.32 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3526  glycine cleavage system T protein  54.59 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3019  glycine cleavage system T protein  50.79 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1018  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.16 
 
 		 364 aa  277  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1096  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.66 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184957  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26241  predicted protein  41.95 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  38.3 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83560  Aminomethyl transferase  38.26 
 
 		 393 aa  213  5.999999999999999e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04350  aminomethyltransferase, mitochondrial precursor, putative  39.84 
 
 		 409 aa  212  7.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.716927  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0786  glycine cleavage system T protein  38.5 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.56 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0341  glycine cleavage system T protein  42.68 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117183 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.4 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  37.7 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  38.92 
 
 		 367 aa  206  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1996  glycine cleavage system T protein  36.7 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.672194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.77 
 
 		 369 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  39.89 
 
 		 365 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  38.61 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.26 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  37.89 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  39.14 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.73 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.27 
 
 		 366 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.27 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.01 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.27 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.54 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.7 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  38.11 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.75 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.61 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  35.29 
 
 		 360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  40.32 
 
 		 369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>