More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1433 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1433  aminomethyltransferase  100 
 
 		 381 aa  767    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1561  glycine cleavage system T protein  73.78 
 
 		 374 aa  562  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  64.15 
 
 		 374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  63.44 
 
 		 376 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  63.44 
 
 		 376 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1868  glycine cleavage system T protein  61.48 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0707876  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  63.27 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  62.26 
 
 		 409 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  61.73 
 
 		 373 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  62.8 
 
 		 374 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  59.74 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  62.8 
 
 		 374 aa  451  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  61.19 
 
 		 373 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  62.26 
 
 		 373 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2683  glycine cleavage system T protein  61.66 
 
 		 384 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.837498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  61.46 
 
 		 373 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  63 
 
 		 373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1343  glycine cleavage system T protein  61.73 
 
 		 374 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3957  glycine cleavage system T protein  61.66 
 
 		 408 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0748489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3145  glycine cleavage system T protein  64.71 
 
 		 376 aa  441  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05968  glycine cleavage system protein T2  57.84 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2726  glycine cleavage system T protein  56.88 
 
 		 376 aa  435  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000230  aminomethyltransferase (glycine cleavage system T protein)  57.84 
 
 		 372 aa  431  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0949  glycine cleavage system T protein  60 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.51 
 
 		 384 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.3 
 
 		 379 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3299  glycine cleavage system T protein  58.9 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3738  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.33 
 
 		 382 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0571205  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3841  glycine cleavage system T protein  54.59 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1286  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.82 
 
 		 383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.846982  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3019  glycine cleavage system T protein  60.62 
 
 		 403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.48 
 
 		 382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.02 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723708  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0496  glycine cleavage system T protein  54.05 
 
 		 372 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1184  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.53 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394661  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  55.26 
 
 		 380 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4373  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.17 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520618  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1570  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  56.27 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000466042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1889  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.4 
 
 		 378 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163517  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2393  glycine cleavage system T protein  54.99 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.673157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2091  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.87 
 
 		 378 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.85 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1815  glycine cleavage system T protein  54.86 
 
 		 379 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.863047  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4268  glycine cleavage system T protein  54.16 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3620  glycine cleavage system T protein  53.91 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2282  glycine cleavage system T protein  51.09 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.88282 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2211  glycine cleavage system T protein  51.89 
 
 		 365 aa  359  4e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  52.72 
 
 		 370 aa  359  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0534  glycine cleavage system T protein  55.61 
 
 		 377 aa  359  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6035  glycine cleavage system T protein  56.22 
 
 		 380 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.04 
 
 		 377 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2193  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.37 
 
 		 377 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0779  glycine cleavage system T protein  53 
 
 		 392 aa  348  8e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678322  normal  0.0882666 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.37 
 
 		 377 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2694  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  53.21 
 
 		 377 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  52.85 
 
 		 366 aa  338  9e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  51.73 
 
 		 384 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  51.2 
 
 		 381 aa  332  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.86 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0814  glycine cleavage system T protein  54.05 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327481  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0855  glycine cleavage system T protein  53.79 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0510506  normal  0.0771176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  48.11 
 
 		 370 aa  316  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1217  glycine cleavage system T protein  51.06 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2682  aminomethyltransferase, glycine cleavage system T protein  50.14 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.82644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3526  glycine cleavage system T protein  55.68 
 
 		 380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.97 
 
 		 388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3864  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.92 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.782346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0727  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.65 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0681  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.11 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1096  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.78 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184957  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26241  predicted protein  40.05 
 
 		 414 aa  262  6.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1018  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04350  aminomethyltransferase, mitochondrial precursor, putative  39.23 
 
 		 409 aa  239  6.999999999999999e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.716927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.9 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.2 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  41.49 
 
 		 375 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.98 
 
 		 372 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.71 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  36.51 
 
 		 360 aa  226  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.17 
 
 		 369 aa  224  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.33 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.6 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.89 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  43.35 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83560  Aminomethyl transferase  36.73 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.11 
 
 		 374 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  36.63 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  35.15 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0662  glycine cleavage system T protein  38.21 
 
 		 360 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  41.1 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5960  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.18 
 
 		 360 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.87 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68870  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.9 
 
 		 360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  37.5 
 
 		 389 aa  212  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0375  glycine cleavage system T protein  37.18 
 
 		 362 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.38 
 
 		 364 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  37 
 
 		 364 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  36.96 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  37.47 
 
 		 362 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  39.95 
 
 		 350 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>