More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04350 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC04350  aminomethyltransferase, mitochondrial precursor, putative  100 
 
 		 409 aa  844    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.716927  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01198  hypothetical glycine cleavage system T protein (Eurofung)  48.21 
 
 		 480 aa  359  4e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83560  Aminomethyl transferase  46.31 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26241  predicted protein  46.91 
 
 		 414 aa  310  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3841  glycine cleavage system T protein  42.86 
 
 		 375 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  44.56 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0496  glycine cleavage system T protein  44.7 
 
 		 372 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.81 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  42.49 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05968  glycine cleavage system protein T2  42.12 
 
 		 376 aa  279  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  42.34 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.93 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  43.34 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2726  glycine cleavage system T protein  42.38 
 
 		 376 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.12 
 
 		 374 aa  275  7e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000230  aminomethyltransferase (glycine cleavage system T protein)  42.38 
 
 		 372 aa  275  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  42.67 
 
 		 370 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  43.6 
 
 		 373 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1561  glycine cleavage system T protein  40.73 
 
 		 374 aa  272  8.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2211  glycine cleavage system T protein  41.73 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.41 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  41.15 
 
 		 374 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  41.93 
 
 		 374 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  39.54 
 
 		 391 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1343  glycine cleavage system T protein  41.79 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  39.64 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4373  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.09 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  40.36 
 
 		 373 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0949  glycine cleavage system T protein  41.45 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1889  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.42 
 
 		 378 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163517  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  39.39 
 
 		 376 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  40.1 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1184  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.01 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394661  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3738  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.86 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0571205  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  39.58 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2091  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.9 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3957  glycine cleavage system T protein  40.52 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0748489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  39.95 
 
 		 373 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  43.19 
 
 		 381 aa  259  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3299  glycine cleavage system T protein  40.15 
 
 		 392 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1570  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.14 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000466042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  39.69 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  41.04 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1868  glycine cleavage system T protein  39.75 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0707876  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2694  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.1 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.53 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2683  glycine cleavage system T protein  40.05 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.837498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1815  glycine cleavage system T protein  40.62 
 
 		 379 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.863047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2282  glycine cleavage system T protein  39.16 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.88282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1217  glycine cleavage system T protein  39.9 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104927 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.16 
 
 		 377 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2193  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.78 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.78 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0534  glycine cleavage system T protein  40.05 
 
 		 377 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1286  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.28 
 
 		 383 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.846982  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.28 
 
 		 384 aa  242  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0779  glycine cleavage system T protein  39.95 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678322  normal  0.0882666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3145  glycine cleavage system T protein  39.9 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1018  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.14 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4268  glycine cleavage system T protein  38.36 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.79 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1096  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.54 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3019  glycine cleavage system T protein  40.66 
 
 		 403 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6035  glycine cleavage system T protein  38.8 
 
 		 380 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1433  aminomethyltransferase  38.46 
 
 		 381 aa  229  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0727  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.08 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3864  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.56 
 
 		 367 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.782346  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0681  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.82 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  36.55 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.6 
 
 		 360 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2682  aminomethyltransferase, glycine cleavage system T protein  39.27 
 
 		 361 aa  222  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.82644 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.34 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.19 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.53 
 
 		 365 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.96 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2393  glycine cleavage system T protein  38.4 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.673157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.66 
 
 		 360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.64 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.62 
 
 		 369 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.62 
 
 		 369 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.66 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0855  glycine cleavage system T protein  37.89 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0510506  normal  0.0771176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  35.58 
 
 		 361 aa  216  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  38.3 
 
 		 351 aa  216  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.49 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.49 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0814  glycine cleavage system T protein  37.73 
 
 		 392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327481  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.83 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.82 
 
 		 441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.88 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.46 
 
 		 374 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3620  glycine cleavage system T protein  39.84 
 
 		 366 aa  212  9e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.83 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  36.57 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  35.81 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.47 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.26 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.96 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3255  glycine cleavage system T protein  38.52 
 
 		 584 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.26 
 
 		 368 aa  209  9e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>