More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0727 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0727  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 		 367 aa  743    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0681  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  99.46 
 
 		 367 aa  740    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3864  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  95.37 
 
 		 367 aa  713    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.782346  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1096  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.56 
 
 		 373 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1018  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.49 
 
 		 364 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  49.05 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  48.4 
 
 		 374 aa  335  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  48.27 
 
 		 374 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000230  aminomethyltransferase (glycine cleavage system T protein)  49.07 
 
 		 372 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  48.09 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.19 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  47.81 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05968  glycine cleavage system protein T2  48.54 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  47.99 
 
 		 374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  47.21 
 
 		 373 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  48.11 
 
 		 373 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  46.52 
 
 		 409 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  48.92 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0496  glycine cleavage system T protein  47.45 
 
 		 372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1343  glycine cleavage system T protein  47.45 
 
 		 374 aa  318  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.21 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2091  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.89 
 
 		 378 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1561  glycine cleavage system T protein  49.06 
 
 		 374 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  48.68 
 
 		 376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  48.4 
 
 		 384 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1889  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.63 
 
 		 378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163517  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3841  glycine cleavage system T protein  46.32 
 
 		 375 aa  312  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  48.41 
 
 		 376 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2726  glycine cleavage system T protein  46.65 
 
 		 376 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  47.84 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3738  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.15 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0571205  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.6 
 
 		 384 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1184  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.16 
 
 		 379 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394661  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4373  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.62 
 
 		 382 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520618  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3620  glycine cleavage system T protein  49.47 
 
 		 366 aa  308  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0949  glycine cleavage system T protein  47.99 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1570  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.98 
 
 		 384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000466042 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  48.26 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.14 
 
 		 377 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.56 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2193  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.4 
 
 		 377 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.49 
 
 		 387 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723708  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  47.93 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.48 
 
 		 374 aa  299  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2393  glycine cleavage system T protein  49.07 
 
 		 374 aa  299  5e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.673157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1815  glycine cleavage system T protein  45.45 
 
 		 379 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.863047  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1433  aminomethyltransferase  46.11 
 
 		 381 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.07 
 
 		 377 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1286  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.88 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.846982  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  45.53 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2282  glycine cleavage system T protein  44.38 
 
 		 366 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.88282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0534  glycine cleavage system T protein  45.36 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6035  glycine cleavage system T protein  45.62 
 
 		 380 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2211  glycine cleavage system T protein  44.14 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.2 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1868  glycine cleavage system T protein  44.53 
 
 		 398 aa  282  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0707876  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3957  glycine cleavage system T protein  45.41 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0748489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  44.63 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3145  glycine cleavage system T protein  47.06 
 
 		 376 aa  279  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0779  glycine cleavage system T protein  47.47 
 
 		 392 aa  278  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678322  normal  0.0882666 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2683  glycine cleavage system T protein  47.62 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.837498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1217  glycine cleavage system T protein  46.74 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3299  glycine cleavage system T protein  47 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0855  glycine cleavage system T protein  46.4 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0510506  normal  0.0771176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0814  glycine cleavage system T protein  46.67 
 
 		 392 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327481  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3019  glycine cleavage system T protein  46.92 
 
 		 403 aa  265  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4268  glycine cleavage system T protein  43.12 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3526  glycine cleavage system T protein  48.8 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2682  aminomethyltransferase, glycine cleavage system T protein  44.9 
 
 		 361 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.82644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  41.76 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2694  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.32 
 
 		 377 aa  248  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26241  predicted protein  38.99 
 
 		 414 aa  245  6.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04350  aminomethyltransferase, mitochondrial precursor, putative  38.08 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.716927  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.3 
 
 		 370 aa  226  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  37.25 
 
 		 357 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  40.56 
 
 		 365 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83560  Aminomethyl transferase  36.87 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  36.29 
 
 		 371 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.73 
 
 		 369 aa  212  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.63 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.25 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  40.43 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  40.33 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.17 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  37.94 
 
 		 361 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  37.3 
 
 		 371 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01198  hypothetical glycine cleavage system T protein (Eurofung)  37.31 
 
 		 480 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  38.24 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  38.11 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  35.01 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  38.66 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  37.14 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  37.2 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.77 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.84 
 
 		 365 aa  206  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  39.07 
 
 		 366 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  36.84 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  36.78 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.01 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  37.4 
 
 		 367 aa  203  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>