More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1096 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1096  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 		 373 aa  768    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184957  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0727  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.56 
 
 		 367 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0681  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.29 
 
 		 367 aa  481  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3864  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.19 
 
 		 367 aa  471  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.782346  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1018  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.3 
 
 		 364 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1343  glycine cleavage system T protein  47.99 
 
 		 374 aa  329  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0991  glycine cleavage system T protein  47.86 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4232  glycine cleavage system T protein  47.33 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0986  glycine cleavage system T protein  47.45 
 
 		 373 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1023  glycine cleavage system T protein  47.72 
 
 		 373 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1095  glycine cleavage system T protein  47.07 
 
 		 374 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0280431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05968  glycine cleavage system protein T2  46.92 
 
 		 376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3051  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.96 
 
 		 375 aa  319  6e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000230  aminomethyltransferase (glycine cleavage system T protein)  46.65 
 
 		 372 aa  318  9e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  46.65 
 
 		 374 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4394  glycine cleavage system T protein  46.4 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  47.17 
 
 		 373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1275  glycine cleavage system T protein  45.21 
 
 		 409 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1184  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.15 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394661  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0496  glycine cleavage system T protein  45.04 
 
 		 372 aa  308  6.999999999999999e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2726  glycine cleavage system T protein  47.54 
 
 		 376 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2809  glycine cleavage system protein T2  46.9 
 
 		 373 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0733  glycine cleavage system T protein  46.79 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0358369 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2091  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.01 
 
 		 378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0688  glycine cleavage system T protein  46.09 
 
 		 380 aa  305  9.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1889  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.48 
 
 		 378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163517  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0949  glycine cleavage system T protein  46.17 
 
 		 376 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.67 
 
 		 379 aa  302  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1570  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.36 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000466042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1561  glycine cleavage system T protein  45.7 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6035  glycine cleavage system T protein  47.24 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.4 
 
 		 384 aa  295  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3738  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.62 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0571205  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0814  glycine cleavage system T protein  47.42 
 
 		 392 aa  291  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327481  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0855  glycine cleavage system T protein  47.04 
 
 		 392 aa  291  9e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0510506  normal  0.0771176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4373  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.42 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.520618  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2193  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.24 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  45.75 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1286  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.27 
 
 		 383 aa  290  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.846982  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0868  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.97 
 
 		 377 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1733  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.09 
 
 		 382 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3841  glycine cleavage system T protein  42.25 
 
 		 375 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4326  glycine cleavage system T protein  45.36 
 
 		 391 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.0579992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.17 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723708  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2348  glycine cleavage system T protein  43.94 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0843782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1741  glycine cleavage system T protein  43.7 
 
 		 376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.959068  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2211  glycine cleavage system T protein  44.47 
 
 		 365 aa  282  6.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1938  glycine cleavage system T protein  43.7 
 
 		 376 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.976777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2282  glycine cleavage system T protein  43.21 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.88282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2299  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.12 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0534  glycine cleavage system T protein  45.43 
 
 		 377 aa  275  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2393  glycine cleavage system T protein  44.03 
 
 		 374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.673157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1815  glycine cleavage system T protein  43.4 
 
 		 379 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.863047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1868  glycine cleavage system T protein  41.8 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0707876  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3299  glycine cleavage system T protein  44.09 
 
 		 392 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0779  glycine cleavage system T protein  45.1 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678322  normal  0.0882666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3145  glycine cleavage system T protein  45.48 
 
 		 376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1433  aminomethyltransferase  42.51 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1217  glycine cleavage system T protein  44.57 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3620  glycine cleavage system T protein  42.66 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1871  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.77 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  0.125667 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4268  glycine cleavage system T protein  42.55 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2683  glycine cleavage system T protein  42.02 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.837498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26241  predicted protein  40.21 
 
 		 414 aa  263  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3526  glycine cleavage system T protein  47.23 
 
 		 380 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3957  glycine cleavage system T protein  42.43 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0748489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4387  glycine cleavage system T protein  42.19 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.817765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2201  glycine cleavage system T protein  42.82 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.399384 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3019  glycine cleavage system T protein  42.97 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1850  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.23 
 
 		 388 aa  249  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0344364  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2682  aminomethyltransferase, glycine cleavage system T protein  42.86 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.82644 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04350  aminomethyltransferase, mitochondrial precursor, putative  38.54 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.716927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2694  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.03 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  37.19 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  37.29 
 
 		 357 aa  222  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.8 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  35.64 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  39.89 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.845128 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01198  hypothetical glycine cleavage system T protein (Eurofung)  37.13 
 
 		 480 aa  219  7.999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.63 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83560  Aminomethyl transferase  35.53 
 
 		 393 aa  215  8e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  37.5 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.37 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  38.59 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.87 
 
 		 366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.66 
 
 		 374 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.06 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.79 
 
 		 360 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.77 
 
 		 369 aa  210  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  35.48 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  37.25 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1904  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.94 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.94 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00965774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  35.85 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  33.7 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  36.51 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  36.36 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.81 
 
 		 359 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.78 
 
 		 365 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  35.15 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>