81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2050 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2050  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 357 aa  697    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3243  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.48 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2440  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  38.15 
 
 		 353 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.725548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3254  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  40.27 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00636832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0125  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  36.8 
 
 		 356 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1827  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  35.91 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2211  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  34.21 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0668352  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2132  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  36.88 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0649  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  38.21 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00997  periplasmic sensory protein associated with the TorRS two-component regulatory system  40 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01004  hypothetical protein  40 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3216  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  35.29 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1112  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  39.34 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00670153  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000318  periplasmic protein TorT precursor  36.21 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.393901  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2129  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  38.34 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2601  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  39.67 
 
 		 342 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.429826 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1105  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  39.67 
 
 		 342 aa  192  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1231  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  39.67 
 
 		 342 aa  192  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2648  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  39.67 
 
 		 342 aa  192  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.058876  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1151  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  34.32 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.451598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3533  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.32 
 
 		 352 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.292009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3355  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.58 
 
 		 364 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1113  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  32.12 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3216  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  33.99 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3346  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  33.87 
 
 		 354 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0979105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1048  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  32.67 
 
 		 355 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1052  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  32.67 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1229  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.18 
 
 		 359 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2281  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  36.24 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3366  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.15 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1991  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.53 
 
 		 357 aa  176  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4108  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  37.5 
 
 		 346 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4157  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  37.5 
 
 		 346 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4215  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  37.17 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2802  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  33.23 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4036  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  37.17 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4053  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  36.84 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0984  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  33.11 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06120  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  32.74 
 
 		 283 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3890  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.77 
 
 		 360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0443  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  28.8 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3816  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  28.8 
 
 		 360 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0421  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  30.07 
 
 		 361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.553546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4013  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.34 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39350  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  27.93 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.743894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3346  ribose ABC transporter periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1919  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.43 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0247  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.1 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626925  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1866  putative ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  26.03 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2019  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  23.13 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395211  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1853  putative ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  23.13 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0558  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.48 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2475  binding protein component precursor of ABC ribose transporter  23.13 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7364  ABC transporter substrate binding protein  21.8 
 
 		 316 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4012  hypothetical protein  46.81 
 
 		 109 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  23.16 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1631  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.03 
 
 		 316 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.817449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3236  monosaccharide-transporting ATPase  23.87 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.271334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2685  Monosaccharide-transporting ATPase  25 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.450778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1956  monosaccharide-transporting ATPase  24.21 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0141518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4132  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.93 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.86 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1017  sugar-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  23.32 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.353153  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.19 
 
 		 311 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.68 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  24 
 
 		 308 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2605  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.95 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0273  RbsB protein  23.13 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1373  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.09 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.507324  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0583  monosaccharide-transporting ATPase  26.8 
 
 		 307 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09540  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.16 
 
 		 320 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0566218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2650  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.29 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0990  ABC sugar transporter, periplasmic sugar binding subunit  23.29 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  22.66 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0798  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  26.14 
 
 		 308 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000267941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0701  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  26.14 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4637  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  26.14 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.146123  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.96 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0234  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.33 
 
 		 345 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.594018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0069  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.4 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>