47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2802 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2802  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  100 
 
 		 387 aa  801    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3366  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  65.41 
 
 		 375 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3533  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  63.2 
 
 		 352 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.292009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1991  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  58.87 
 
 		 357 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1048  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  62.39 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1113  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  63.34 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1052  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  62.36 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3216  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  61.03 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3216  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  60.74 
 
 		 363 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1151  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  58.36 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.451598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3355  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  59.27 
 
 		 364 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1229  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  61.05 
 
 		 359 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3346  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  56.79 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0979105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0984  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  51.12 
 
 		 345 aa  333  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2132  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  38.18 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000318  periplasmic protein TorT precursor  38.87 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.393901  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0649  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  36.88 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3254  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.64 
 
 		 356 aa  186  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00636832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06120  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  37.46 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1827  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  35.05 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1112  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  37.46 
 
 		 342 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00670153  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2648  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  37.14 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.058876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2601  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  37.14 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.429826 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1105  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  37.14 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00997  periplasmic sensory protein associated with the TorRS two-component regulatory system  37.14 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01004  hypothetical protein  37.14 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3243  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.39 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2129  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  36.19 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2440  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.4 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.725548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1231  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  36.83 
 
 		 342 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0125  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.89 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4108  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  32.12 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4157  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  32.12 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4215  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  32.12 
 
 		 346 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4053  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.84 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4036  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  31.84 
 
 		 346 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2050  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2281  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  34.29 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2211  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  24.29 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0668352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0443  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.14 
 
 		 360 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3890  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  28.88 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3816  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.14 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0421  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  27.05 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.553546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4012  hypothetical protein  50.91 
 
 		 109 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4013  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.9 
 
 		 199 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2582  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.93 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  26.46 
 
 		 371 aa  42.7  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>