43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4012 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4012  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3890  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  98.97 
 
 		 360 aa  206  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3816  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  96.91 
 
 		 360 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0443  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  95.88 
 
 		 360 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0421  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  68.33 
 
 		 361 aa  97.1  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.553546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1048  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  45.65 
 
 		 355 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2440  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  38.95 
 
 		 353 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.725548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3254  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  46.25 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00636832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0984  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  41.76 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1151  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  43.01 
 
 		 359 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.451598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3216  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  54.24 
 
 		 363 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3216  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  54.24 
 
 		 363 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3355  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  54.24 
 
 		 364 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1113  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  52.54 
 
 		 355 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1052  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  52.54 
 
 		 355 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1229  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  54.9 
 
 		 359 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3533  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  50 
 
 		 352 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.292009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0125  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  40 
 
 		 356 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3346  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  38.3 
 
 		 354 aa  67  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0979105  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2132  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  45.45 
 
 		 331 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2211  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  38.64 
 
 		 379 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0668352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2802  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  50.91 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1991  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  49.02 
 
 		 357 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3243  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.3 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3366  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  47.06 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01004  hypothetical protein  47.17 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00997  periplasmic sensory protein associated with the TorRS two-component regulatory system  47.17 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2129  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  44.9 
 
 		 342 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2050  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.81 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2648  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  47.17 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.058876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2601  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  47.17 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.429826 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1112  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  47.17 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00670153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1105  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  47.17 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1231  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  42.86 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2281  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  49.02 
 
 		 321 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000318  periplasmic protein TorT precursor  47.62 
 
 		 334 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.393901  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1827  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  42.5 
 
 		 356 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4108  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  40 
 
 		 346 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4157  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  40 
 
 		 346 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4036  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  40 
 
 		 346 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4053  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  40 
 
 		 346 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4215  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  40 
 
 		 346 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0649  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  45.24 
 
 		 330 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>