56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3816 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0443  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  98.06 
 
 		 360 aa  724    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3816  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  100 
 
 		 360 aa  736    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3890  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  96.67 
 
 		 360 aa  693    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4013  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  99.5 
 
 		 199 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0421  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  54.86 
 
 		 361 aa  348  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.553546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2440  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  39.32 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.725548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3254  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  38.22 
 
 		 356 aa  219  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00636832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0125  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  39.07 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4012  hypothetical protein  96.91 
 
 		 109 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3243  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.16 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2211  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  34.49 
 
 		 379 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0668352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2050  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.8 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1827  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.59 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2132  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.13 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3216  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  30.24 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1048  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  30.25 
 
 		 355 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1151  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  28.89 
 
 		 359 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.451598 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3346  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  30.73 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0979105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3355  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  28.96 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3216  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.1 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1229  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  30.63 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01004  hypothetical protein  29 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00997  periplasmic sensory protein associated with the TorRS two-component regulatory system  29 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1113  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.32 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2601  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  28.67 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.429826 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2648  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  28.67 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.058876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1105  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  28.67 
 
 		 342 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1052  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.79 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.61821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1112  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  28.33 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00670153  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2129  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  28.04 
 
 		 342 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1231  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  27.7 
 
 		 342 aa  123  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4036  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  26.01 
 
 		 346 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1991  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.19 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4108  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  26.01 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4157  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  26.01 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4053  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  25.68 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4215  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  26.01 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000318  periplasmic protein TorT precursor  28.19 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.393901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2802  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.14 
 
 		 387 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3366  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  28.53 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3533  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  29.01 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.292009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0984  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  26.63 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2281  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  30.43 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0649  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  24.5 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06120  TMAO reductase system periplasmic protein TorT  26.45 
 
 		 283 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09540  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.8 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0566218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.59 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182523  normal  0.0264597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1401  ribose ABC transporter, substrate binding protein  24.03 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0413  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.79 
 
 		 312 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000162891  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  25.98 
 
 		 445 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.32 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1618  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.14 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0054  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.36 
 
 		 309 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5305  ABC transporter, binding protein  27.33 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.325241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.38 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>