More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0364 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0364  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 391 aa  764    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.244589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 		 410 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1267  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0583334  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  23.4 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.2 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  21.73 
 
 		 452 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  21.19 
 
 		 409 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 		 454 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  26.88 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  28.57 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  24.7 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  29.49 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  21.03 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  30.7 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0316  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.451798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  19.43 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2418  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2138  amylovoran biosynthesis AmsK  27.07 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0369934  normal  0.0657655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.31 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  21.72 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  22.63 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  24.83 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  20.82 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  19.09 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  21.65 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  21.01 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  21.12 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.94 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  22.92 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.91 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  23.55 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 770 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  23.55 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  23.55 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2376  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3431  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1683  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  24.38 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  23.14 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  24.38 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  20.85 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  24.15 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  22.07 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  21.08 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.14 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  22.15 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  23.14 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  32.85 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  21.63 
 
 		 739 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  29.78 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 406 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  23.55 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>