More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2138 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2138  amylovoran biosynthesis AmsK  100 
 
 
429 aa  879    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0369934  normal  0.0657655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2376  glycosyl transferase, group 1  50.24 
 
 
418 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0316  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
424 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.451798  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1267  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
411 aa  186  8e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0583334  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.51 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.14 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  23.82 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
368 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0364  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
391 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.244589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  22.72 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2418  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392541  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
398 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3907  glycosyl transferase, group 1  35.78 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
411 aa  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 
365 aa  63.9  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
417 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
369 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
372 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.4 
 
 
411 aa  63.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
364 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
382 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
409 aa  63.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
505 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
396 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  27.17 
 
 
391 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
382 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
381 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
396 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 
394 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  35.25 
 
 
346 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12393  Glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
336 aa  61.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
1302 aa  61.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
364 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
385 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
364 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  27.41 
 
 
368 aa  60.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
379 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
390 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
409 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 
389 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0391  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
378 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  40.3 
 
 
439 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
404 aa  60.1  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
390 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
391 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
378 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
370 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
386 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  30.98 
 
 
342 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
382 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
409 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
389 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
744 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
388 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  29.81 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  27.56 
 
 
964 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1680  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
405 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383608  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  30.53 
 
 
816 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
409 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
390 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
396 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
388 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
394 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>