More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1878 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2024  2-isopropylmalate synthase  56.77 
 
 		 557 aa  653    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1878  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 539 aa  1125    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.501905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2515  2-isopropylmalate synthase  57.59 
 
 		 563 aa  657    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1162  2-isopropylmalate synthase  53.75 
 
 		 594 aa  617  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0153276 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1229  2-isopropylmalate synthase  53.21 
 
 		 594 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.104882 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1019  2-isopropylmalate synthase  55.02 
 
 		 586 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406917  hitchhiker  0.00437661 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3353  2-isopropylmalate synthase  52.08 
 
 		 578 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378646  normal  0.239583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1732  2-isopropylmalate synthase  54.46 
 
 		 564 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00246769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1708  pyruvate carboxyltransferase  51.77 
 
 		 562 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.903372  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1989  2-isopropylmalate synthase  53.69 
 
 		 567 aa  567  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.07459  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1658  2-isopropylmalate synthase  53.69 
 
 		 567 aa  567  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.332271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  49.91 
 
 		 557 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  49.35 
 
 		 557 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  49.72 
 
 		 557 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  49.72 
 
 		 557 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  49.81 
 
 		 585 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  49.08 
 
 		 571 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  50.73 
 
 		 565 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  49.08 
 
 		 563 aa  551  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1673  2-isopropylmalate synthase  49.28 
 
 		 559 aa  552  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  49.44 
 
 		 556 aa  554  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  49.26 
 
 		 556 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  49.26 
 
 		 559 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  49.36 
 
 		 556 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  49.64 
 
 		 577 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  48.8 
 
 		 556 aa  542  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  49.2 
 
 		 576 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  48.33 
 
 		 557 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  48.33 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  49.44 
 
 		 592 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  48.89 
 
 		 556 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  48.15 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  48.74 
 
 		 594 aa  538  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1890  2-isopropylmalate synthase  48.61 
 
 		 552 aa  538  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  49.36 
 
 		 553 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  48.75 
 
 		 569 aa  534  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  47.7 
 
 		 553 aa  534  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  47.51 
 
 		 575 aa  532  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  48.56 
 
 		 569 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4179  2-isopropylmalate synthase  48.06 
 
 		 555 aa  530  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  47.32 
 
 		 570 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  47.32 
 
 		 570 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  46.06 
 
 		 567 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  47.59 
 
 		 565 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3548  2-isopropylmalate synthase  46.14 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  47.22 
 
 		 572 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  48.82 
 
 		 584 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  47.4 
 
 		 598 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0183  2-isopropylmalate synthase  47.29 
 
 		 565 aa  531  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.140386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  47.97 
 
 		 549 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1566  2-isopropylmalate synthase  47.79 
 
 		 555 aa  525  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0204  2-isopropylmalate synthase  47.29 
 
 		 560 aa  527  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1513  2-isopropylmalate synthase  47.79 
 
 		 575 aa  525  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  46.48 
 
 		 570 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0138  2-isopropylmalate synthase  46.93 
 
 		 560 aa  523  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370913  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  47.34 
 
 		 595 aa  522  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  48.52 
 
 		 562 aa  525  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3249  2-isopropylmalate synthase  47.51 
 
 		 568 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  46.95 
 
 		 581 aa  521  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  47.22 
 
 		 572 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  47.56 
 
 		 584 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  46.67 
 
 		 569 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  46.78 
 
 		 558 aa  519  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  47.65 
 
 		 569 aa  521  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  46.67 
 
 		 570 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  46.67 
 
 		 570 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0400  2-isopropylmalate synthase  46.86 
 
 		 558 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  46.67 
 
 		 570 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2965  2-isopropylmalate synthase  47.07 
 
 		 559 aa  521  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0782206  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  48.09 
 
 		 577 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1599  2-isopropylmalate synthase  47.23 
 
 		 573 aa  519  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471841  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  47.51 
 
 		 607 aa  521  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  46.9 
 
 		 586 aa  518  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  45.6 
 
 		 566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  48.03 
 
 		 554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2190  2-isopropylmalate synthase  46.62 
 
 		 570 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  46.77 
 
 		 575 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  46.77 
 
 		 576 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  46.47 
 
 		 563 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  45.69 
 
 		 590 aa  512  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  46.04 
 
 		 598 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  46.52 
 
 		 585 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  46.48 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  46.49 
 
 		 559 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2319  2-isopropylmalate synthase  45.42 
 
 		 562 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  45.68 
 
 		 580 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2478  2-isopropylmalate synthase  45.75 
 
 		 560 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  46.13 
 
 		 601 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  46.13 
 
 		 601 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2287  2-isopropylmalate synthase  46.22 
 
 		 576 aa  508  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  46.13 
 
 		 601 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  46.8 
 
 		 579 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  47.17 
 
 		 556 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  46.98 
 
 		 579 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  46 
 
 		 622 aa  500  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  46.86 
 
 		 606 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  45.95 
 
 		 580 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89189  Alpha-isopropylmalate synthase/homocitrate synthase (LEU4)  46.43 
 
 		 575 aa  496  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0336795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0304  2-isopropylmalate synthase  45.79 
 
 		 551 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  46.2 
 
 		 568 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>