More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3249 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1599  2-isopropylmalate synthase  81.28 
 
 		 573 aa  966    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471841  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1566  2-isopropylmalate synthase  81.01 
 
 		 555 aa  949    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  55.52 
 
 		 622 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3249  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 568 aa  1178    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44763  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  56.17 
 
 		 601 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3070  2-isopropylmalate synthase  85.28 
 
 		 560 aa  1000    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0535231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2287  2-isopropylmalate synthase  84.75 
 
 		 576 aa  1021    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  60.32 
 
 		 558 aa  715    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  56.12 
 
 		 606 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1513  2-isopropylmalate synthase  81 
 
 		 575 aa  959    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2804  2-isopropylmalate synthase  85.87 
 
 		 577 aa  1007    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  55.79 
 
 		 569 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  56.17 
 
 		 601 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2190  2-isopropylmalate synthase  77.6 
 
 		 570 aa  932    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 		 598 aa  638    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  56.17 
 
 		 601 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  55.32 
 
 		 557 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 		 557 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  55.32 
 
 		 557 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0455  2-isopropylmalate synthase  56.55 
 
 		 617 aa  634  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  53.83 
 
 		 569 aa  628  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  54.51 
 
 		 598 aa  631  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  55.75 
 
 		 581 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  54.8 
 
 		 570 aa  628  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  54.95 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  54.05 
 
 		 576 aa  627  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  55.1 
 
 		 565 aa  627  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 		 570 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 		 570 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 594 aa  627  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1673  2-isopropylmalate synthase  54.59 
 
 		 559 aa  624  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  53.18 
 
 		 584 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  52.93 
 
 		 585 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  55.32 
 
 		 559 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  52.85 
 
 		 586 aa  620  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2319  2-isopropylmalate synthase  54.17 
 
 		 562 aa  615  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  53.44 
 
 		 575 aa  618  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0183  2-isopropylmalate synthase  53.39 
 
 		 565 aa  615  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.140386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5515  2-isopropylmalate synthase  56.39 
 
 		 612 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  54.19 
 
 		 585 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  54.23 
 
 		 556 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  52.17 
 
 		 571 aa  614  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13742  2-isopropylmalate synthase  51.17 
 
 		 644 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000321849  normal  0.363832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  53.87 
 
 		 556 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  52.86 
 
 		 584 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  52.46 
 
 		 569 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  53.31 
 
 		 557 aa  613  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2478  2-isopropylmalate synthase  54.35 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  53.48 
 
 		 563 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  53 
 
 		 590 aa  611  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  52.17 
 
 		 580 aa  608  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  52.86 
 
 		 570 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0138  2-isopropylmalate synthase  51.99 
 
 		 560 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370913  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  52.89 
 
 		 570 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  53.63 
 
 		 577 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  52.86 
 
 		 569 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  52.79 
 
 		 556 aa  606  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  52.86 
 
 		 570 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  52.86 
 
 		 570 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  53.8 
 
 		 576 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  51.74 
 
 		 607 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0204  2-isopropylmalate synthase  53.43 
 
 		 560 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  52.72 
 
 		 595 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  53.65 
 
 		 592 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1890  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 552 aa  601  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4179  2-isopropylmalate synthase  52.97 
 
 		 555 aa  597  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  53.12 
 
 		 556 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  51.47 
 
 		 579 aa  592  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  50.54 
 
 		 567 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12300  2-isopropylmalate synthase  53.17 
 
 		 577 aa  588  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  53.3 
 
 		 568 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  51.98 
 
 		 559 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3548  2-isopropylmalate synthase  52.54 
 
 		 556 aa  591  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  51.44 
 
 		 572 aa  591  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 		 565 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  50.71 
 
 		 572 aa  591  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  51.82 
 
 		 579 aa  590  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  52.19 
 
 		 553 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  52.48 
 
 		 562 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0193  2-isopropylmalate synthase  51.89 
 
 		 559 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  0.779806 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  51.27 
 
 		 554 aa  585  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  50.52 
 
 		 577 aa  586  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  50.73 
 
 		 566 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3353  2-isopropylmalate synthase  52.06 
 
 		 578 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378646  normal  0.239583 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  50.54 
 
 		 557 aa  579  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2024  2-isopropylmalate synthase  51.83 
 
 		 557 aa  581  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  50.54 
 
 		 557 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  50.18 
 
 		 567 aa  578  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1279  2-isopropylmalate synthase  48.98 
 
 		 638 aa  579  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  50.27 
 
 		 563 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2965  2-isopropylmalate synthase  51.37 
 
 		 559 aa  575  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0782206  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  49.73 
 
 		 556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  49.73 
 
 		 553 aa  575  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0726  2-isopropylmalate synthase  50.18 
 
 		 566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.719959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1019  2-isopropylmalate synthase  48.85 
 
 		 586 aa  566  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406917  hitchhiker  0.00437661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  50.35 
 
 		 580 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  49.91 
 
 		 556 aa  558  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1732  2-isopropylmalate synthase  50.72 
 
 		 564 aa  558  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00246769  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1687  2-isopropylmalate synthase  48.83 
 
 		 555 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0264  2-isopropylmalate synthase  51.96 
 
 		 564 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00392516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>