More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3235 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  57.96 
 
 
557 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  65.33 
 
 
586 aa  748    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  57.96 
 
 
557 aa  652    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  57.07 
 
 
557 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  73.04 
 
 
576 aa  882    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  68.28 
 
 
585 aa  822    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  58.19 
 
 
556 aa  671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  57.73 
 
 
576 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  55.89 
 
 
585 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  58.19 
 
 
570 aa  676    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  66.49 
 
 
598 aa  783    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  55.76 
 
 
556 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  55.54 
 
 
568 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  64.46 
 
 
595 aa  758    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  78.39 
 
 
559 aa  908    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1764  2-isopropylmalate synthase  67.08 
 
 
571 aa  757    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0726  2-isopropylmalate synthase  75.22 
 
 
566 aa  891    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.719959  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  56.71 
 
 
557 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12300  2-isopropylmalate synthase  62.41 
 
 
577 aa  702    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  56.07 
 
 
556 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  56.89 
 
 
557 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  56.33 
 
 
559 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  63.68 
 
 
601 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  63.89 
 
 
590 aa  738    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  58.89 
 
 
570 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  65.96 
 
 
594 aa  778    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  55.46 
 
 
565 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  62.83 
 
 
622 aa  724    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3794  2-isopropylmalate synthase  65.02 
 
 
579 aa  748    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508283  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  58.71 
 
 
570 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  59.61 
 
 
558 aa  670    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  58.19 
 
 
570 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  57.24 
 
 
567 aa  662    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
569 aa  1179    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  70.37 
 
 
581 aa  807    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  68.49 
 
 
577 aa  809    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  53.96 
 
 
556 aa  643    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  56.99 
 
 
557 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13742  2-isopropylmalate synthase  60.26 
 
 
644 aa  712    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000321849  normal  0.363832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  65.43 
 
 
584 aa  776    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  56.89 
 
 
557 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  57.37 
 
 
562 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  56.53 
 
 
566 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  56.81 
 
 
572 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  56.99 
 
 
572 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  61.01 
 
 
607 aa  729    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  55.89 
 
 
571 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  65.57 
 
 
579 aa  772    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  70.05 
 
 
565 aa  822    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  60 
 
 
567 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  58.71 
 
 
569 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  64.46 
 
 
569 aa  743    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  58.71 
 
 
570 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  63.68 
 
 
601 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  64.26 
 
 
584 aa  757    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  66.14 
 
 
598 aa  790    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  57.35 
 
 
563 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  58.38 
 
 
563 aa  655    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  65.97 
 
 
575 aa  777    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  57.27 
 
 
556 aa  650    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  56.25 
 
 
592 aa  641    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  65.4 
 
 
579 aa  775    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  56.05 
 
 
570 aa  638    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  58.71 
 
 
570 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  64.92 
 
 
606 aa  742    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  57.12 
 
 
549 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  63.21 
 
 
580 aa  738    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  79.89 
 
 
577 aa  931    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1279  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 
638 aa  653    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  71.28 
 
 
569 aa  852    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  72.74 
 
 
580 aa  857    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  63.68 
 
 
601 aa  748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0455  2-isopropylmalate synthase  62.35 
 
 
617 aa  730    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5515  2-isopropylmalate synthase  63.35 
 
 
612 aa  706    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  54.76 
 
 
575 aa  626  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2342  2-isopropylmalate synthase  54.97 
 
 
573 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  56.17 
 
 
556 aa  620  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  53.14 
 
 
554 aa  619  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2889  2-isopropylmalate synthase  57.27 
 
 
571 aa  614  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00713702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2287  2-isopropylmalate synthase  52.46 
 
 
576 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  53.75 
 
 
553 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  55.81 
 
 
553 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3249  2-isopropylmalate synthase  52.46 
 
 
568 aa  613  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44763  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1687  2-isopropylmalate synthase  52.76 
 
 
555 aa  611  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1566  2-isopropylmalate synthase  53.33 
 
 
555 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1513  2-isopropylmalate synthase  52.85 
 
 
575 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2190  2-isopropylmalate synthase  53 
 
 
570 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3070  2-isopropylmalate synthase  53.69 
 
 
560 aa  601  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0535231  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1599  2-isopropylmalate synthase  52.14 
 
 
573 aa  601  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471841  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2804  2-isopropylmalate synthase  52.85 
 
 
577 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0019  2-isopropylmalate synthase  53.93 
 
 
587 aa  597  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00840  2-isopropylmalate synthase (Eurofung)  51.3 
 
 
648 aa  592  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931626  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1229  2-isopropylmalate synthase  49.4 
 
 
594 aa  588  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.104882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1292  2-isopropylmalate synthase  52.75 
 
 
558 aa  591  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2338  2-isopropylmalate synthase  52.13 
 
 
558 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1673  2-isopropylmalate synthase  51.24 
 
 
559 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0400  2-isopropylmalate synthase  51.88 
 
 
558 aa  581  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3353  2-isopropylmalate synthase  51.14 
 
 
578 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378646  normal  0.239583 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89189  Alpha-isopropylmalate synthase/homocitrate synthase (LEU4)  50.44 
 
 
575 aa  577  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0336795  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0304  2-isopropylmalate synthase  53.49 
 
 
551 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>