More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1927 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  63.32 
 
 		 586 aa  733    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  65.03 
 
 		 575 aa  745    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  58.96 
 
 		 556 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  65.26 
 
 		 565 aa  755    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  58.39 
 
 		 557 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  58.57 
 
 		 557 aa  645    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  58.57 
 
 		 557 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3794  2-isopropylmalate synthase  59.64 
 
 		 579 aa  666    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508283  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  58.06 
 
 		 585 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  57.71 
 
 		 556 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  68.87 
 
 		 559 aa  776    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  61.64 
 
 		 584 aa  719    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  61.43 
 
 		 622 aa  696    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12300  2-isopropylmalate synthase  60.97 
 
 		 577 aa  679    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  60.95 
 
 		 607 aa  715    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  57.07 
 
 		 572 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  63.14 
 
 		 598 aa  735    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  57.5 
 
 		 570 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  61.46 
 
 		 580 aa  707    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  61.38 
 
 		 594 aa  723    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  62.5 
 
 		 590 aa  713    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  62.74 
 
 		 598 aa  736    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0455  2-isopropylmalate synthase  60.81 
 
 		 617 aa  686    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965842  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  66.31 
 
 		 577 aa  777    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  60.68 
 
 		 584 aa  711    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  64.32 
 
 		 569 aa  746    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  67.9 
 
 		 581 aa  764    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  57.25 
 
 		 572 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  57.86 
 
 		 557 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  61.86 
 
 		 601 aa  705    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  59.25 
 
 		 567 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  64.34 
 
 		 579 aa  748    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  58.39 
 
 		 570 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  61.86 
 
 		 601 aa  705    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  64.62 
 
 		 576 aa  760    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13742  2-isopropylmalate synthase  57.87 
 
 		 644 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000321849  normal  0.363832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  59.14 
 
 		 557 aa  650    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  58.06 
 
 		 556 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  65.47 
 
 		 585 aa  766    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  62.57 
 
 		 606 aa  699    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  72.74 
 
 		 569 aa  857    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  58.78 
 
 		 592 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  63.81 
 
 		 579 aa  741    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  58.39 
 
 		 570 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  58.39 
 
 		 569 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1764  2-isopropylmalate synthase  64.27 
 
 		 571 aa  714    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  73.76 
 
 		 577 aa  850    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  61.63 
 
 		 569 aa  689    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 580 aa  1190    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  64.05 
 
 		 595 aa  737    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  61.86 
 
 		 601 aa  705    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0726  2-isopropylmalate synthase  67.49 
 
 		 566 aa  792    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.719959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5515  2-isopropylmalate synthase  61.71 
 
 		 612 aa  670    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  58.39 
 
 		 570 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  55.67 
 
 		 568 aa  633  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  57.04 
 
 		 559 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  56.45 
 
 		 558 aa  634  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  56.11 
 
 		 570 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  56.11 
 
 		 570 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1279  2-isopropylmalate synthase  52.75 
 
 		 638 aa  625  1e-178  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  55.99 
 
 		 576 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  55.54 
 
 		 556 aa  622  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  57.53 
 
 		 562 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  54.92 
 
 		 566 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  55.73 
 
 		 557 aa  623  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  56.27 
 
 		 565 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  56.71 
 
 		 571 aa  618  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  55.05 
 
 		 563 aa  620  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  55.56 
 
 		 557 aa  621  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  56.31 
 
 		 570 aa  616  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 		 563 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  55.54 
 
 		 553 aa  614  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  54.66 
 
 		 575 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  55.04 
 
 		 549 aa  610  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  54.12 
 
 		 556 aa  611  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  53.75 
 
 		 567 aa  608  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 553 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1687  2-isopropylmalate synthase  54.29 
 
 		 555 aa  588  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4179  2-isopropylmalate synthase  53.21 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1673  2-isopropylmalate synthase  51.33 
 
 		 559 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 556 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  52.15 
 
 		 554 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0304  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 		 551 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0019  2-isopropylmalate synthase  53.82 
 
 		 587 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2319  2-isopropylmalate synthase  50.97 
 
 		 562 aa  579  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2342  2-isopropylmalate synthase  51.39 
 
 		 573 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2965  2-isopropylmalate synthase  50.45 
 
 		 559 aa  572  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0782206  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1229  2-isopropylmalate synthase  48.45 
 
 		 594 aa  571  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.104882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2889  2-isopropylmalate synthase  54.26 
 
 		 571 aa  571  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00713702 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0183  2-isopropylmalate synthase  50.97 
 
 		 565 aa  565  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.140386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1890  2-isopropylmalate synthase  50.18 
 
 		 552 aa  568  1e-160  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4995  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3249  2-isopropylmalate synthase  50.35 
 
 		 568 aa  566  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44763  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01520  2-isopropylmalate synthase, putative  48.8 
 
 		 639 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0965657  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0138  2-isopropylmalate synthase  51.15 
 
 		 560 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370913  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1162  2-isopropylmalate synthase  47.41 
 
 		 594 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0153276 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2478  2-isopropylmalate synthase  50.97 
 
 		 560 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2024  2-isopropylmalate synthase  49.2 
 
 		 557 aa  559  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2287  2-isopropylmalate synthase  50.09 
 
 		 576 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0204  2-isopropylmalate synthase  50.62 
 
 		 560 aa  560  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1292  2-isopropylmalate synthase  50.98 
 
 		 558 aa  558  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>