More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2373 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 		 569 aa  634    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  58.38 
 
 		 576 aa  681    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  54.25 
 
 		 549 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  60 
 
 		 557 aa  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  59.58 
 
 		 570 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  59.51 
 
 		 569 aa  699    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  59.5 
 
 		 576 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  59.07 
 
 		 556 aa  688    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  58.97 
 
 		 585 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  59.39 
 
 		 557 aa  681    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  59.5 
 
 		 556 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  54.66 
 
 		 568 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  56.56 
 
 		 569 aa  648    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  56.64 
 
 		 598 aa  643    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  74.28 
 
 		 557 aa  884    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  56.62 
 
 		 553 aa  650    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  58.79 
 
 		 559 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  60.29 
 
 		 570 aa  696    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  58.48 
 
 		 570 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 567 aa  1174    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  57.37 
 
 		 556 aa  670    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  58.65 
 
 		 570 aa  681    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  55.42 
 
 		 556 aa  638    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  73.5 
 
 		 563 aa  888    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  58.35 
 
 		 577 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  59.71 
 
 		 557 aa  701    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 556 aa  638    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  56.53 
 
 		 553 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  74.09 
 
 		 557 aa  880    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  58.38 
 
 		 562 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  74.87 
 
 		 566 aa  887    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  61.11 
 
 		 572 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  59.46 
 
 		 557 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  57.54 
 
 		 571 aa  677    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  60.94 
 
 		 567 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  60.99 
 
 		 572 aa  715    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  59.51 
 
 		 570 aa  698    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  54.96 
 
 		 601 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  55.22 
 
 		 575 aa  654    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  61.45 
 
 		 563 aa  704    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  57.19 
 
 		 592 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  59.82 
 
 		 557 aa  699    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  59.51 
 
 		 570 aa  698    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  54.96 
 
 		 601 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  60.29 
 
 		 570 aa  696    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  53.63 
 
 		 584 aa  635    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  57.3 
 
 		 577 aa  645    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  58.71 
 
 		 565 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  57.24 
 
 		 569 aa  662    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  55.93 
 
 		 565 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  54.96 
 
 		 601 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2889  2-isopropylmalate synthase  69.89 
 
 		 571 aa  798    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00713702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  57.67 
 
 		 585 aa  665    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 		 559 aa  634  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  54.63 
 
 		 558 aa  632  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  54.31 
 
 		 622 aa  631  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  54.43 
 
 		 598 aa  633  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  55.73 
 
 		 581 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  54.51 
 
 		 594 aa  630  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1687  2-isopropylmalate synthase  54.4 
 
 		 555 aa  631  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  54.61 
 
 		 606 aa  629  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  55.26 
 
 		 586 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  56.01 
 
 		 575 aa  629  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  55.05 
 
 		 590 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0455  2-isopropylmalate synthase  53.55 
 
 		 617 aa  625  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965842  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0019  2-isopropylmalate synthase  55.38 
 
 		 587 aa  628  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  55.03 
 
 		 580 aa  625  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  53.37 
 
 		 554 aa  623  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  53.61 
 
 		 556 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0726  2-isopropylmalate synthase  54.9 
 
 		 566 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.719959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12300  2-isopropylmalate synthase  54.37 
 
 		 577 aa  620  1e-176  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13742  2-isopropylmalate synthase  51.32 
 
 		 644 aa  618  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000321849  normal  0.363832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 		 579 aa  617  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  55.99 
 
 		 595 aa  615  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  53.75 
 
 		 584 aa  617  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  53.93 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0304  2-isopropylmalate synthase  54.2 
 
 		 551 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  53.7 
 
 		 579 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  53.75 
 
 		 580 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5515  2-isopropylmalate synthase  54.12 
 
 		 612 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0489  2-isopropylmalate synthase  55.7 
 
 		 548 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2338  2-isopropylmalate synthase  52.41 
 
 		 558 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1229  2-isopropylmalate synthase  49.56 
 
 		 594 aa  591  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.104882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2198  2-isopropylmalate synthase  55.52 
 
 		 548 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2812  2-isopropylmalate synthase  55.52 
 
 		 548 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1566  2-isopropylmalate synthase  51.27 
 
 		 555 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2024  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 557 aa  585  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1292  2-isopropylmalate synthase  51.43 
 
 		 558 aa  588  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1513  2-isopropylmalate synthase  51.27 
 
 		 575 aa  587  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2287  2-isopropylmalate synthase  51.64 
 
 		 576 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2872  2-isopropylmalate synthase  62.61 
 
 		 548 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2823  2-isopropylmalate synthase  55.15 
 
 		 548 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1484  2-isopropylmalate synthase  64.75 
 
 		 546 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3135  2-isopropylmalate synthase  64.75 
 
 		 546 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0734  2-isopropylmalate synthase  64.75 
 
 		 546 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.406609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6142  2-isopropylmalate synthase  54.97 
 
 		 548 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4179  2-isopropylmalate synthase  49.64 
 
 		 555 aa  583  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0183  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 		 565 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.140386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1162  2-isopropylmalate synthase  49.12 
 
 		 594 aa  584  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0153276 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2913  2-isopropylmalate synthase  64.75 
 
 		 546 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>