More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3492 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  57.99 
 
 		 585 aa  673    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  59.07 
 
 		 567 aa  688    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  79.71 
 
 		 557 aa  929    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0304  2-isopropylmalate synthase  58.62 
 
 		 551 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  65.09 
 
 		 576 aa  740    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  55.96 
 
 		 579 aa  641    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2889  2-isopropylmalate synthase  58.04 
 
 		 571 aa  647    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00713702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  59.93 
 
 		 557 aa  694    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  56.99 
 
 		 595 aa  651    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  80.76 
 
 		 585 aa  940    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  56.51 
 
 		 601 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  80.22 
 
 		 556 aa  936    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  58.19 
 
 		 569 aa  671    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  58.12 
 
 		 568 aa  660    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  79.35 
 
 		 557 aa  925    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  57.55 
 
 		 559 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  56.11 
 
 		 575 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  58.66 
 
 		 565 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  56.21 
 
 		 622 aa  649    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  58.23 
 
 		 553 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  79.79 
 
 		 559 aa  936    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  79.71 
 
 		 557 aa  931    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  64.62 
 
 		 570 aa  756    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  56.16 
 
 		 569 aa  640    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  58.14 
 
 		 581 aa  647    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  54.98 
 
 		 598 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 556 aa  1152    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  60.36 
 
 		 570 aa  684    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  87.25 
 
 		 557 aa  1015    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  65.34 
 
 		 570 aa  757    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  56.96 
 
 		 558 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  59.74 
 
 		 557 aa  695    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  58.88 
 
 		 577 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  60.11 
 
 		 556 aa  683    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  57.3 
 
 		 556 aa  651    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  60.14 
 
 		 553 aa  705    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  58.32 
 
 		 569 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0726  2-isopropylmalate synthase  58.27 
 
 		 566 aa  664    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.719959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  61.73 
 
 		 562 aa  689    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  59.35 
 
 		 566 aa  685    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  64.39 
 
 		 572 aa  749    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  63.54 
 
 		 570 aa  734    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  83.09 
 
 		 556 aa  955    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  62.79 
 
 		 571 aa  716    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  56.93 
 
 		 549 aa  643    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  61.55 
 
 		 567 aa  722    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  59.1 
 
 		 554 aa  671    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  65.52 
 
 		 569 aa  756    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  65.34 
 
 		 570 aa  754    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  56.51 
 
 		 601 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  58.68 
 
 		 575 aa  683    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  56.51 
 
 		 601 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  57.8 
 
 		 576 aa  669    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  55.28 
 
 		 590 aa  637    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  56.64 
 
 		 586 aa  647    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  79.53 
 
 		 557 aa  928    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  61.82 
 
 		 565 aa  694    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  83.45 
 
 		 592 aa  955    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  56.32 
 
 		 579 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  65.34 
 
 		 570 aa  754    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  64.75 
 
 		 572 aa  750    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  59.89 
 
 		 563 aa  694    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  55.81 
 
 		 598 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  58.56 
 
 		 563 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  56.63 
 
 		 577 aa  647    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  63.54 
 
 		 570 aa  734    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  58.06 
 
 		 580 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2024  2-isopropylmalate synthase  54.63 
 
 		 557 aa  631  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  55.7 
 
 		 556 aa  633  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  56.33 
 
 		 606 aa  632  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  56.16 
 
 		 580 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  55.6 
 
 		 607 aa  627  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1687  2-isopropylmalate synthase  54.94 
 
 		 555 aa  628  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0455  2-isopropylmalate synthase  54.37 
 
 		 617 aa  627  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  54.48 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0489  2-isopropylmalate synthase  59.1 
 
 		 548 aa  621  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  54.29 
 
 		 584 aa  619  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2823  2-isopropylmalate synthase  59.28 
 
 		 548 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2872  2-isopropylmalate synthase  59.28 
 
 		 548 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  54.55 
 
 		 584 aa  618  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2913  2-isopropylmalate synthase  59.1 
 
 		 546 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3135  2-isopropylmalate synthase  59.1 
 
 		 546 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3249  2-isopropylmalate synthase  53.87 
 
 		 568 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44763  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1484  2-isopropylmalate synthase  59.1 
 
 		 546 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6142  2-isopropylmalate synthase  59.1 
 
 		 548 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2287  2-isopropylmalate synthase  53.86 
 
 		 576 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282842 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0459  2-isopropylmalate synthase  68.09 
 
 		 546 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0567  2-isopropylmalate synthase  59.1 
 
 		 546 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2198  2-isopropylmalate synthase  58.92 
 
 		 548 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0104  2-isopropylmalate synthase  59.1 
 
 		 546 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2986  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2730  2-isopropylmalate synthase  58.99 
 
 		 548 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2812  2-isopropylmalate synthase  58.92 
 
 		 548 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2338  2-isopropylmalate synthase  53.79 
 
 		 558 aa  611  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0734  2-isopropylmalate synthase  58.92 
 
 		 546 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.406609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0551  2-isopropylmalate synthase  58.92 
 
 		 546 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13742  2-isopropylmalate synthase  52.58 
 
 		 644 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000321849  normal  0.363832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2515  2-isopropylmalate synthase  54.83 
 
 		 563 aa  608  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5515  2-isopropylmalate synthase  55.04 
 
 		 612 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0019  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 		 587 aa  608  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12300  2-isopropylmalate synthase  55.06 
 
 		 577 aa  605  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>