More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0183 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2319  2-isopropylmalate synthase  72.66 
 
 
562 aa  868    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0138  2-isopropylmalate synthase  70.13 
 
 
560 aa  844    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370913  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1673  2-isopropylmalate synthase  69.89 
 
 
559 aa  841    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  54.82 
 
 
558 aa  661    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0193  2-isopropylmalate synthase  74.24 
 
 
559 aa  882    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  0.779806 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0183  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
565 aa  1175    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.140386  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0204  2-isopropylmalate synthase  72.27 
 
 
560 aa  870    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2478  2-isopropylmalate synthase  71.2 
 
 
560 aa  855    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3548  2-isopropylmalate synthase  53.58 
 
 
556 aa  626  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180442  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1890  2-isopropylmalate synthase  53.76 
 
 
552 aa  626  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4179  2-isopropylmalate synthase  54.14 
 
 
555 aa  619  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  52.3 
 
 
557 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3249  2-isopropylmalate synthase  53.39 
 
 
568 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  52.3 
 
 
557 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  52.3 
 
 
557 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  52.13 
 
 
557 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3070  2-isopropylmalate synthase  55.44 
 
 
560 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0535231  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2804  2-isopropylmalate synthase  55.28 
 
 
577 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  52.38 
 
 
565 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  52.69 
 
 
571 aa  605  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1599  2-isopropylmalate synthase  52.44 
 
 
573 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2190  2-isopropylmalate synthase  53.62 
 
 
570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1566  2-isopropylmalate synthase  52.16 
 
 
555 aa  601  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  51.58 
 
 
556 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1513  2-isopropylmalate synthase  52.32 
 
 
575 aa  601  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3353  2-isopropylmalate synthase  52.5 
 
 
578 aa  600  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378646  normal  0.239583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  51.42 
 
 
559 aa  595  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2287  2-isopropylmalate synthase  52.72 
 
 
576 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  53.06 
 
 
576 aa  596  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  51.06 
 
 
585 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2024  2-isopropylmalate synthase  50.9 
 
 
557 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273488  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  51.97 
 
 
566 aa  592  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  52.41 
 
 
563 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  51.74 
 
 
585 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  51.44 
 
 
570 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  52.58 
 
 
568 aa  588  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  51.44 
 
 
570 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  51.76 
 
 
586 aa  586  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 
567 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  51.16 
 
 
576 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  51.54 
 
 
607 aa  581  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  51.79 
 
 
577 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  52.37 
 
 
569 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  51.22 
 
 
557 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 
577 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  51.94 
 
 
569 aa  579  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  51.77 
 
 
584 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  50.71 
 
 
575 aa  578  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  50.71 
 
 
592 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  51.05 
 
 
557 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  50.71 
 
 
556 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  51.32 
 
 
581 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  52.08 
 
 
594 aa  578  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  50.18 
 
 
556 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  50.89 
 
 
570 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  50.97 
 
 
572 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  52.17 
 
 
572 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  52.36 
 
 
601 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  52.36 
 
 
601 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  52.36 
 
 
601 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  51.17 
 
 
569 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  50.27 
 
 
570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  51.18 
 
 
595 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  50.98 
 
 
590 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  52.62 
 
 
565 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  52.39 
 
 
569 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  50.71 
 
 
567 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  49.47 
 
 
580 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  51.17 
 
 
570 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  51.17 
 
 
570 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0264  2-isopropylmalate synthase  53.23 
 
 
564 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00392516  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  51.24 
 
 
584 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  51.45 
 
 
598 aa  569  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  48.84 
 
 
556 aa  569  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  53.42 
 
 
562 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  51.25 
 
 
579 aa  570  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  49.28 
 
 
556 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  49.46 
 
 
554 aa  569  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  50.71 
 
 
557 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2965  2-isopropylmalate synthase  48.65 
 
 
559 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0782206  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  51.15 
 
 
598 aa  571  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 
575 aa  566  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  51.34 
 
 
579 aa  568  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  50.97 
 
 
580 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  49.1 
 
 
549 aa  561  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2515  2-isopropylmalate synthase  49.02 
 
 
563 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 
606 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  51.18 
 
 
553 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1162  2-isopropylmalate synthase  49.28 
 
 
594 aa  558  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0153276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13742  2-isopropylmalate synthase  48.48 
 
 
644 aa  561  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000321849  normal  0.363832 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1012  2-isopropylmalate synthase  48.73 
 
 
557 aa  558  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000269973  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1019  2-isopropylmalate synthase  47.86 
 
 
586 aa  555  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406917  hitchhiker  0.00437661 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1229  2-isopropylmalate synthase  49.02 
 
 
594 aa  558  1e-157  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.104882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  49.55 
 
 
563 aa  555  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  50.97 
 
 
559 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  49.36 
 
 
556 aa  556  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12300  2-isopropylmalate synthase  50.52 
 
 
577 aa  558  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 
570 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1732  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 
564 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00246769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  48.21 
 
 
553 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>