More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1461 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  56.42 
 
 		 557 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  56.22 
 
 		 585 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  61.98 
 
 		 556 aa  714    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  56.34 
 
 		 556 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  55.42 
 
 		 567 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  55.32 
 
 		 570 aa  634    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  56.7 
 
 		 570 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  56.96 
 
 		 557 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 556 aa  1149    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  56.42 
 
 		 557 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  56.76 
 
 		 556 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  62.82 
 
 		 556 aa  750    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  56.42 
 
 		 557 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  55.69 
 
 		 572 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  56.65 
 
 		 572 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  55.25 
 
 		 571 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  55.5 
 
 		 567 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  57.58 
 
 		 554 aa  694    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  75.32 
 
 		 553 aa  872    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0400  2-isopropylmalate synthase  54.79 
 
 		 558 aa  638    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  60.69 
 
 		 549 aa  681    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  55.7 
 
 		 556 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  55.23 
 
 		 565 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  55.32 
 
 		 570 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  55.32 
 
 		 570 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  55.32 
 
 		 569 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 		 570 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  56.06 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 		 570 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  54.5 
 
 		 558 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  56.32 
 
 		 592 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  56.12 
 
 		 576 aa  626  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  55.1 
 
 		 559 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  55.15 
 
 		 563 aa  623  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  56.96 
 
 		 577 aa  623  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  56.17 
 
 		 569 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  54.43 
 
 		 557 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  54.33 
 
 		 563 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  54.33 
 
 		 557 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 		 577 aa  618  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  54.87 
 
 		 565 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  53.33 
 
 		 566 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  56.58 
 
 		 559 aa  611  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  52.61 
 
 		 553 aa  610  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  53.62 
 
 		 575 aa  608  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  54.43 
 
 		 570 aa  605  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  55.4 
 
 		 562 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.534107 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00840  2-isopropylmalate synthase (Eurofung)  52.32 
 
 		 648 aa  598  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2889  2-isopropylmalate synthase  53.79 
 
 		 571 aa  598  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00713702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  54.38 
 
 		 581 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  53.45 
 
 		 586 aa  596  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0726  2-isopropylmalate synthase  55 
 
 		 566 aa  596  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.719959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  52.21 
 
 		 576 aa  591  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  52.14 
 
 		 568 aa  591  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  53.44 
 
 		 595 aa  589  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  53.3 
 
 		 590 aa  588  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  53.24 
 
 		 569 aa  589  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  52.95 
 
 		 598 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  52.3 
 
 		 584 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 580 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  53.81 
 
 		 575 aa  584  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  51.87 
 
 		 584 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2024  2-isopropylmalate synthase  50.82 
 
 		 557 aa  581  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  52.55 
 
 		 580 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0304  2-isopropylmalate synthase  52.51 
 
 		 551 aa  581  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  51.38 
 
 		 585 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  51.06 
 
 		 598 aa  575  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  52.77 
 
 		 594 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1513  2-isopropylmalate synthase  51.37 
 
 		 575 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2190  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 		 570 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89189  Alpha-isopropylmalate synthase/homocitrate synthase (LEU4)  50.97 
 
 		 575 aa  577  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0336795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1566  2-isopropylmalate synthase  51.19 
 
 		 555 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  51.24 
 
 		 622 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  50.36 
 
 		 569 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1229  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 		 594 aa  571  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.104882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  51.5 
 
 		 579 aa  571  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68770  2-isopropylmalate synthase (Alpha-isopropylmalate synthase) (Alpha-IPM synthetase)  51.23 
 
 		 571 aa  571  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  50.45 
 
 		 601 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2515  2-isopropylmalate synthase  52.11 
 
 		 563 aa  569  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1162  2-isopropylmalate synthase  48.4 
 
 		 594 aa  569  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0153276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  50.45 
 
 		 601 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  51.68 
 
 		 579 aa  571  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  50.45 
 
 		 601 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1599  2-isopropylmalate synthase  50.27 
 
 		 573 aa  565  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471841  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  51.15 
 
 		 607 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  50.62 
 
 		 606 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2338  2-isopropylmalate synthase  50.63 
 
 		 558 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3249  2-isopropylmalate synthase  49.91 
 
 		 568 aa  558  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44763  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1687  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 555 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0019  2-isopropylmalate synthase  51.71 
 
 		 587 aa  558  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0455  2-isopropylmalate synthase  49.82 
 
 		 617 aa  558  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965842  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13742  2-isopropylmalate synthase  48.25 
 
 		 644 aa  559  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000321849  normal  0.363832 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1019  2-isopropylmalate synthase  47.26 
 
 		 586 aa  557  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406917  hitchhiker  0.00437661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4179  2-isopropylmalate synthase  50.09 
 
 		 555 aa  558  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1292  2-isopropylmalate synthase  51.08 
 
 		 558 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0183  2-isopropylmalate synthase  49.36 
 
 		 565 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.140386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1764  2-isopropylmalate synthase  53.94 
 
 		 571 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2287  2-isopropylmalate synthase  49.91 
 
 		 576 aa  558  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2965  2-isopropylmalate synthase  49.45 
 
 		 559 aa  558  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0782206  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2823  2-isopropylmalate synthase  58.58 
 
 		 548 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>