More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0748 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  58.51 
 
 
557 aa  671    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  55.61 
 
 
601 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  63.02 
 
 
557 aa  733    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  62.84 
 
 
557 aa  732    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  67.65 
 
 
563 aa  781    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  71.78 
 
 
576 aa  842    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0019  2-isopropylmalate synthase  60.11 
 
 
587 aa  679    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  56.13 
 
 
569 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  61.01 
 
 
585 aa  714    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  61.73 
 
 
556 aa  723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  58.38 
 
 
567 aa  686    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  66.85 
 
 
568 aa  773    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  72.02 
 
 
570 aa  843    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  57.86 
 
 
559 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  73.57 
 
 
570 aa  870    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1687  2-isopropylmalate synthase  60.14 
 
 
555 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2338  2-isopropylmalate synthase  59.64 
 
 
558 aa  672    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  62.48 
 
 
557 aa  728    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  59.53 
 
 
565 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  61.76 
 
 
559 aa  717    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2889  2-isopropylmalate synthase  57.45 
 
 
571 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00713702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  57.84 
 
 
553 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  73.21 
 
 
570 aa  865    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1292  2-isopropylmalate synthase  58.05 
 
 
558 aa  658    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  57.92 
 
 
556 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 
585 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0304  2-isopropylmalate synthase  58.17 
 
 
551 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  56.43 
 
 
558 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  55.89 
 
 
606 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5293  2-isopropylmalate synthase  59.42 
 
 
566 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  58.33 
 
 
557 aa  669    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  57.37 
 
 
569 aa  660    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  59.78 
 
 
577 aa  670    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  58.7 
 
 
565 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  63.02 
 
 
557 aa  733    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  57.87 
 
 
553 aa  677    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  61.73 
 
 
556 aa  708    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  58.51 
 
 
563 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
562 aa  1160    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  59.31 
 
 
566 aa  681    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  71.58 
 
 
572 aa  845    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  71.02 
 
 
572 aa  844    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  58.01 
 
 
571 aa  681    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  73.35 
 
 
569 aa  867    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  60.43 
 
 
567 aa  700    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  57.07 
 
 
576 aa  649    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  73.39 
 
 
570 aa  868    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  55.61 
 
 
601 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  57.94 
 
 
575 aa  673    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  61.91 
 
 
556 aa  702    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  67.86 
 
 
570 aa  777    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  61.55 
 
 
592 aa  700    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  73.39 
 
 
570 aa  868    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  57.19 
 
 
586 aa  640    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  62.2 
 
 
557 aa  704    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  57.99 
 
 
577 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  55.91 
 
 
598 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  57.53 
 
 
580 aa  639    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0726  2-isopropylmalate synthase  57.89 
 
 
566 aa  656    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.719959  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  55.61 
 
 
601 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  58.26 
 
 
581 aa  649    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  72.02 
 
 
570 aa  843    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13742  2-isopropylmalate synthase  53.5 
 
 
644 aa  631  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000321849  normal  0.363832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  55.73 
 
 
622 aa  634  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  55.64 
 
 
598 aa  631  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  55.68 
 
 
556 aa  629  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 
584 aa  631  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  55.44 
 
 
594 aa  626  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  54.83 
 
 
590 aa  624  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  55.5 
 
 
556 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  54.05 
 
 
584 aa  624  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  55.64 
 
 
549 aa  624  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2024  2-isopropylmalate synthase  55.8 
 
 
557 aa  622  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273488  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0455  2-isopropylmalate synthase  53.69 
 
 
617 aa  624  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  54.82 
 
 
580 aa  619  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 
575 aa  618  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  54.37 
 
 
569 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  54.61 
 
 
607 aa  617  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  55.81 
 
 
595 aa  618  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2823  2-isopropylmalate synthase  67.5 
 
 
548 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2198  2-isopropylmalate synthase  67.5 
 
 
548 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  54.96 
 
 
579 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 
579 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2812  2-isopropylmalate synthase  67.5 
 
 
548 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0459  2-isopropylmalate synthase  68.28 
 
 
546 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0489  2-isopropylmalate synthase  67.5 
 
 
548 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538256  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3135  2-isopropylmalate synthase  68.05 
 
 
546 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6142  2-isopropylmalate synthase  67.05 
 
 
548 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0400  2-isopropylmalate synthase  52.42 
 
 
558 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0567  2-isopropylmalate synthase  68.05 
 
 
546 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0104  2-isopropylmalate synthase  68.05 
 
 
546 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1484  2-isopropylmalate synthase  68.05 
 
 
546 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4179  2-isopropylmalate synthase  55.17 
 
 
555 aa  606  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2872  2-isopropylmalate synthase  67.05 
 
 
548 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2913  2-isopropylmalate synthase  68.05 
 
 
546 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0551  2-isopropylmalate synthase  68.05 
 
 
546 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3249  2-isopropylmalate synthase  52.48 
 
 
568 aa  601  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0734  2-isopropylmalate synthase  67.82 
 
 
546 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.406609  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12300  2-isopropylmalate synthase  54.72 
 
 
577 aa  604  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2190  2-isopropylmalate synthase  54.25 
 
 
570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>