More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2913 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0104  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
546 aa  1113    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  57.3 
 
 
557 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2730  2-isopropylmalate synthase  83.94 
 
 
548 aa  891    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  67.95 
 
 
576 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  59.1 
 
 
556 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  58.58 
 
 
585 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3135  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
546 aa  1113    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  58.35 
 
 
556 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  57.48 
 
 
557 aa  649    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  69.32 
 
 
570 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0734  2-isopropylmalate synthase  99.82 
 
 
546 aa  1112    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.406609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  57.97 
 
 
559 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6142  2-isopropylmalate synthase  83.58 
 
 
548 aa  886    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  68.14 
 
 
570 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0567  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
546 aa  1113    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0459  2-isopropylmalate synthase  96.15 
 
 
546 aa  1001    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  57.3 
 
 
557 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0489  2-isopropylmalate synthase  84.67 
 
 
548 aa  899    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538256  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  59.08 
 
 
562 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  59.96 
 
 
572 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  59.75 
 
 
567 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  57.66 
 
 
557 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2198  2-isopropylmalate synthase  85.4 
 
 
548 aa  902    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  69.32 
 
 
570 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0551  2-isopropylmalate synthase  99.82 
 
 
546 aa  1112    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  69.32 
 
 
569 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2872  2-isopropylmalate synthase  84.49 
 
 
548 aa  897    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0304  2-isopropylmalate synthase  79.85 
 
 
551 aa  904    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  59.6 
 
 
572 aa  661    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2823  2-isopropylmalate synthase  85.4 
 
 
548 aa  900    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2812  2-isopropylmalate synthase  85.4 
 
 
548 aa  902    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669024  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  69.32 
 
 
570 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2913  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
546 aa  1113    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1484  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
546 aa  1113    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  55.78 
 
 
553 aa  632  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  56.58 
 
 
557 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  66.97 
 
 
570 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  66.97 
 
 
570 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  56.67 
 
 
556 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  56.84 
 
 
570 aa  626  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  56.67 
 
 
592 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  55.32 
 
 
575 aa  621  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  56.12 
 
 
557 aa  617  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  56.12 
 
 
557 aa  615  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  56.6 
 
 
565 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  55.25 
 
 
567 aa  615  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  55.01 
 
 
568 aa  611  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  55.43 
 
 
566 aa  614  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  64.77 
 
 
563 aa  611  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  54.93 
 
 
563 aa  614  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1687  2-isopropylmalate synthase  55.68 
 
 
555 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  53.2 
 
 
576 aa  593  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0019  2-isopropylmalate synthase  59.31 
 
 
587 aa  588  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  55.17 
 
 
571 aa  590  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  63.99 
 
 
556 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  54.69 
 
 
553 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  53.16 
 
 
554 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  55.16 
 
 
569 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  53.41 
 
 
569 aa  578  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  53.07 
 
 
556 aa  578  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2889  2-isopropylmalate synthase  63.13 
 
 
571 aa  580  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00713702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  52.53 
 
 
585 aa  576  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  52.59 
 
 
559 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  52.67 
 
 
569 aa  575  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  51.46 
 
 
549 aa  568  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  52.8 
 
 
565 aa  569  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  52.23 
 
 
558 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0573  2-isopropylmalate synthase  79.6 
 
 
369 aa  571  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.0181569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2338  2-isopropylmalate synthase  53.82 
 
 
558 aa  568  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 
595 aa  566  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  52.88 
 
 
577 aa  566  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  52.71 
 
 
556 aa  567  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  51.52 
 
 
598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3794  2-isopropylmalate synthase  52.63 
 
 
579 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508283  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5293  2-isopropylmalate synthase  52.98 
 
 
566 aa  558  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  51.42 
 
 
601 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  53.14 
 
 
577 aa  559  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  51.42 
 
 
601 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  51.42 
 
 
601 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  51.77 
 
 
580 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1292  2-isopropylmalate synthase  52.15 
 
 
558 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  51.05 
 
 
586 aa  555  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2024  2-isopropylmalate synthase  50.46 
 
 
557 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273488  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13742  2-isopropylmalate synthase  53.49 
 
 
644 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000321849  normal  0.363832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  51.16 
 
 
598 aa  555  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  50.71 
 
 
622 aa  548  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1229  2-isopropylmalate synthase  58.03 
 
 
594 aa  551  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.104882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  61.04 
 
 
607 aa  548  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  51.42 
 
 
606 aa  551  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12300  2-isopropylmalate synthase  58.21 
 
 
577 aa  551  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  51.14 
 
 
590 aa  549  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  52.06 
 
 
581 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0726  2-isopropylmalate synthase  51.26 
 
 
566 aa  548  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.719959  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1162  2-isopropylmalate synthase  57.57 
 
 
594 aa  546  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0153276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  51.17 
 
 
594 aa  548  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 
580 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  50.53 
 
 
575 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  50.35 
 
 
579 aa  545  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 
584 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  49.82 
 
 
579 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>