More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0013 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  54.22 
 
 		 556 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  60.54 
 
 		 557 aa  715    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  59.74 
 
 		 556 aa  702    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  66.91 
 
 		 576 aa  788    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  59.24 
 
 		 563 aa  694    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  59.71 
 
 		 585 aa  695    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2889  2-isopropylmalate synthase  60.64 
 
 		 571 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00713702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  60.73 
 
 		 556 aa  707    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  61.66 
 
 		 568 aa  740    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  57.89 
 
 		 559 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  60.36 
 
 		 557 aa  712    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1687  2-isopropylmalate synthase  58.05 
 
 		 555 aa  672    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  60.68 
 
 		 567 aa  708    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  59.49 
 
 		 559 aa  700    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  56.81 
 
 		 594 aa  639    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  68.31 
 
 		 572 aa  817    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  64.71 
 
 		 570 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  56.58 
 
 		 598 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  56.86 
 
 		 598 aa  635    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  67.33 
 
 		 570 aa  787    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 563 aa  1162    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1292  2-isopropylmalate synthase  55.98 
 
 		 558 aa  637    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0019  2-isopropylmalate synthase  57.14 
 
 		 587 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  58.65 
 
 		 569 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  56.68 
 
 		 558 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  57.22 
 
 		 586 aa  642    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  58.66 
 
 		 565 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  55.6 
 
 		 601 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  59.25 
 
 		 577 aa  659    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  59.45 
 
 		 556 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  60.36 
 
 		 557 aa  714    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  59.1 
 
 		 553 aa  693    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  59.53 
 
 		 557 aa  697    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  61.08 
 
 		 557 aa  719    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  67.21 
 
 		 562 aa  765    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  59.46 
 
 		 566 aa  696    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  65.94 
 
 		 569 aa  784    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  68.31 
 
 		 572 aa  820    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  56.42 
 
 		 565 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  59.06 
 
 		 571 aa  681    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  59.36 
 
 		 567 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  59.53 
 
 		 557 aa  697    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  67.33 
 
 		 570 aa  787    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  58.44 
 
 		 569 aa  658    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  65.94 
 
 		 570 aa  785    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  55.6 
 
 		 601 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  59.75 
 
 		 575 aa  683    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  57.87 
 
 		 590 aa  647    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  59.45 
 
 		 592 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0726  2-isopropylmalate synthase  56.99 
 
 		 566 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.719959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  65.94 
 
 		 570 aa  785    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  65.76 
 
 		 570 aa  784    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  60.82 
 
 		 576 aa  678    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  58.73 
 
 		 557 aa  690    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  58.24 
 
 		 577 aa  659    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  63.42 
 
 		 570 aa  744    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  57.12 
 
 		 585 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5293  2-isopropylmalate synthase  56.89 
 
 		 566 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  55.6 
 
 		 601 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  55.22 
 
 		 553 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2338  2-isopropylmalate synthase  55.56 
 
 		 558 aa  634  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  55.42 
 
 		 556 aa  633  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  55.46 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  57.02 
 
 		 581 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13742  2-isopropylmalate synthase  51.99 
 
 		 644 aa  629  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000321849  normal  0.363832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  56.57 
 
 		 580 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  57.04 
 
 		 595 aa  628  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  55.28 
 
 		 580 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  55.2 
 
 		 622 aa  626  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  54.79 
 
 		 606 aa  625  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0455  2-isopropylmalate synthase  54.71 
 
 		 617 aa  625  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  55.22 
 
 		 556 aa  627  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0304  2-isopropylmalate synthase  56.12 
 
 		 551 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  55.75 
 
 		 579 aa  621  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1566  2-isopropylmalate synthase  55.07 
 
 		 555 aa  620  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  56.52 
 
 		 579 aa  620  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2190  2-isopropylmalate synthase  56.75 
 
 		 570 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1513  2-isopropylmalate synthase  54.89 
 
 		 575 aa  620  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3249  2-isopropylmalate synthase  53.5 
 
 		 568 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44763  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  55.58 
 
 		 575 aa  616  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  55.21 
 
 		 584 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  54.66 
 
 		 584 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  54.59 
 
 		 569 aa  610  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1599  2-isopropylmalate synthase  54.97 
 
 		 573 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471841  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12300  2-isopropylmalate synthase  54.36 
 
 		 577 aa  605  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  54.42 
 
 		 607 aa  607  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3070  2-isopropylmalate synthase  54.33 
 
 		 560 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0535231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2287  2-isopropylmalate synthase  53.51 
 
 		 576 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5515  2-isopropylmalate synthase  53.59 
 
 		 612 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2024  2-isopropylmalate synthase  53.76 
 
 		 557 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2804  2-isopropylmalate synthase  53.25 
 
 		 577 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  51.45 
 
 		 549 aa  594  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0489  2-isopropylmalate synthase  65.06 
 
 		 548 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1732  2-isopropylmalate synthase  53.15 
 
 		 564 aa  588  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00246769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0459  2-isopropylmalate synthase  65.23 
 
 		 546 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1764  2-isopropylmalate synthase  55.96 
 
 		 571 aa  590  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2913  2-isopropylmalate synthase  64.77 
 
 		 546 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3135  2-isopropylmalate synthase  64.77 
 
 		 546 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1484  2-isopropylmalate synthase  64.77 
 
 		 546 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0567  2-isopropylmalate synthase  64.77 
 
 		 546 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>