More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5515 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0455  2-isopropylmalate synthase  80.67 
 
 		 617 aa  994    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965842  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  65.26 
 
 		 584 aa  765    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  66.78 
 
 		 576 aa  775    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1566  2-isopropylmalate synthase  57.35 
 
 		 555 aa  644    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  70.19 
 
 		 598 aa  830    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  85.9 
 
 		 601 aa  1082    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  62.11 
 
 		 559 aa  703    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  65.81 
 
 		 584 aa  767    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  67.01 
 
 		 595 aa  773    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  70.25 
 
 		 598 aa  880    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  67.02 
 
 		 569 aa  762    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  64.08 
 
 		 607 aa  753    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  63.86 
 
 		 579 aa  736    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0726  2-isopropylmalate synthase  61.58 
 
 		 566 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.719959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1513  2-isopropylmalate synthase  57.17 
 
 		 575 aa  644    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  65.13 
 
 		 580 aa  754    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  57.27 
 
 		 558 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  62.54 
 
 		 586 aa  723    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2287  2-isopropylmalate synthase  57.61 
 
 		 576 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  61.9 
 
 		 577 aa  721    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12300  2-isopropylmalate synthase  63.86 
 
 		 577 aa  719    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  54.61 
 
 		 566 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3249  2-isopropylmalate synthase  56.39 
 
 		 568 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  62.67 
 
 		 565 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  66.14 
 
 		 569 aa  763    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  56.16 
 
 		 571 aa  647    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13742  2-isopropylmalate synthase  76.58 
 
 		 644 aa  976    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000321849  normal  0.363832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  67.12 
 
 		 585 aa  776    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  80.6 
 
 		 622 aa  994    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  85.9 
 
 		 601 aa  1082    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2190  2-isopropylmalate synthase  59.34 
 
 		 570 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1599  2-isopropylmalate synthase  56.27 
 
 		 573 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  68.95 
 
 		 594 aa  842    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  65.57 
 
 		 575 aa  746    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  65.05 
 
 		 579 aa  741    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  63.35 
 
 		 569 aa  733    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1279  2-isopropylmalate synthase  54.95 
 
 		 638 aa  686    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  62.15 
 
 		 577 aa  704    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  61.71 
 
 		 580 aa  695    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  85.9 
 
 		 601 aa  1082    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5515  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 612 aa  1262    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  66.9 
 
 		 581 aa  764    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  65.7 
 
 		 590 aa  761    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  88.26 
 
 		 606 aa  1088    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  55.03 
 
 		 570 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2804  2-isopropylmalate synthase  57.66 
 
 		 577 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  55.03 
 
 		 570 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  56.04 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3070  2-isopropylmalate synthase  57.66 
 
 		 560 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0535231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1764  2-isopropylmalate synthase  56.35 
 
 		 571 aa  630  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  55.04 
 
 		 556 aa  631  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  55.4 
 
 		 576 aa  625  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  54.12 
 
 		 567 aa  626  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  54.42 
 
 		 572 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  54.06 
 
 		 572 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  53.91 
 
 		 557 aa  623  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  53.39 
 
 		 557 aa  622  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  53.78 
 
 		 559 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  56.57 
 
 		 567 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  54.87 
 
 		 570 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  53.36 
 
 		 556 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  54.87 
 
 		 569 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  54.87 
 
 		 570 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  54.87 
 
 		 570 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  53.18 
 
 		 585 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  53.6 
 
 		 557 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  53.71 
 
 		 565 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  52.9 
 
 		 557 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  53.98 
 
 		 570 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  53.83 
 
 		 563 aa  611  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  52.72 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  54.06 
 
 		 563 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  55.14 
 
 		 562 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  52.72 
 
 		 557 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  52.11 
 
 		 556 aa  603  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  53.54 
 
 		 554 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  52.48 
 
 		 592 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  52.71 
 
 		 570 aa  600  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  53.18 
 
 		 556 aa  601  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2024  2-isopropylmalate synthase  52.82 
 
 		 557 aa  591  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2342  2-isopropylmalate synthase  51.99 
 
 		 573 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  51.82 
 
 		 568 aa  586  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3794  2-isopropylmalate synthase  54.45 
 
 		 579 aa  588  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508283  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  52.11 
 
 		 553 aa  587  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3353  2-isopropylmalate synthase  52.5 
 
 		 578 aa  585  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378646  normal  0.239583 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3548  2-isopropylmalate synthase  53.3 
 
 		 556 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  51.68 
 
 		 553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  49.56 
 
 		 556 aa  579  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2889  2-isopropylmalate synthase  54.51 
 
 		 571 aa  577  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00713702 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1019  2-isopropylmalate synthase  50.36 
 
 		 586 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406917  hitchhiker  0.00437661 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2319  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 		 562 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0183  2-isopropylmalate synthase  53.09 
 
 		 565 aa  566  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.140386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  50.35 
 
 		 556 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1229  2-isopropylmalate synthase  46.07 
 
 		 594 aa  559  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.104882 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0138  2-isopropylmalate synthase  51.82 
 
 		 560 aa  561  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370913  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0204  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 560 aa  561  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  50.88 
 
 		 575 aa  561  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2478  2-isopropylmalate synthase  51.36 
 
 		 560 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148439  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1162  2-isopropylmalate synthase  47.37 
 
 		 594 aa  556  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0153276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  49.29 
 
 		 549 aa  556  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>