More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1279 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2190  2-isopropylmalate synthase  60.47 
 
 
595 aa  764    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0433784  normal  0.095083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0263  2-isopropylmalate synthase  55.83 
 
 
584 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00953684  decreased coverage  0.000495197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0455  2-isopropylmalate synthase  52.52 
 
 
617 aa  655    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965842  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3988  2-isopropylmalate synthase  54.75 
 
 
622 aa  673    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17210  2-isopropylmalate synthase  59.37 
 
 
607 aa  745    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5266  2-isopropylmalate synthase  55.81 
 
 
601 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0501  2-isopropylmalate synthase  56.07 
 
 
581 aa  693    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3235  2-isopropylmalate synthase  53.08 
 
 
569 aa  653    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.259764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2310  2-isopropylmalate synthase  56 
 
 
569 aa  705    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13742  2-isopropylmalate synthase  52.66 
 
 
644 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000321849  normal  0.363832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7041  2-isopropylmalate synthase  55.35 
 
 
585 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5515  2-isopropylmalate synthase  54.95 
 
 
612 aa  661    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2182  2-isopropylmalate synthase  59.8 
 
 
590 aa  756    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1095  2-isopropylmalate synthase  53.57 
 
 
565 aa  647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57091  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1540  2-isopropylmalate synthase  60.17 
 
 
586 aa  765    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3377  2-isopropylmalate synthase  58.74 
 
 
575 aa  731    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0732306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0213  2-isopropylmalate synthase  54.85 
 
 
598 aa  708    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59936  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0690  2-isopropylmalate synthase  54.28 
 
 
598 aa  677    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3635  2-isopropylmalate synthase  53.34 
 
 
577 aa  644    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36410  2-isopropylmalate synthase  56.07 
 
 
594 aa  692    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.98983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1293  2-isopropylmalate synthase  55.24 
 
 
606 aa  690    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.575891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4898  2-isopropylmalate synthase  55.81 
 
 
601 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0224  2-isopropylmalate synthase  54.82 
 
 
584 aa  699    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1963  2-isopropylmalate synthase  56.64 
 
 
579 aa  707    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13540  2-isopropylmalate synthase  58.87 
 
 
580 aa  736    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2226  2-isopropylmalate synthase  56.98 
 
 
579 aa  709    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12300  2-isopropylmalate synthase  56.67 
 
 
577 aa  689    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1165  2-isopropylmalate synthase  58.07 
 
 
576 aa  729    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151131  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0794  2-isopropylmalate synthase  52.08 
 
 
577 aa  639    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0443849 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1279  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 
638 aa  1319    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4987  2-isopropylmalate synthase  55.81 
 
 
601 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0490  2-isopropylmalate synthase  54.73 
 
 
569 aa  670    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.537178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1927  2-isopropylmalate synthase  52.75 
 
 
580 aa  625  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0850  2-isopropylmalate synthase  52.43 
 
 
559 aa  624  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0726  2-isopropylmalate synthase  51.75 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.719959  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2535  2-isopropylmalate synthase  50.84 
 
 
571 aa  607  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1764  2-isopropylmalate synthase  51.09 
 
 
571 aa  600  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1566  2-isopropylmalate synthase  50.77 
 
 
555 aa  596  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1513  2-isopropylmalate synthase  50.77 
 
 
575 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2190  2-isopropylmalate synthase  51.35 
 
 
570 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1599  2-isopropylmalate synthase  50.17 
 
 
573 aa  595  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471841  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2287  2-isopropylmalate synthase  50.93 
 
 
576 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1928  2-isopropylmalate synthase  50.08 
 
 
558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2321  2-isopropylmalate synthase  49.67 
 
 
566 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3070  2-isopropylmalate synthase  50.85 
 
 
560 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0535231  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3249  2-isopropylmalate synthase  48.98 
 
 
568 aa  579  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2117  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 
565 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5887  2-isopropylmalate synthase  49.32 
 
 
567 aa  581  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2804  2-isopropylmalate synthase  50.51 
 
 
577 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1025  2-isopropylmalate synthase  50.17 
 
 
557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226688  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1023  2-isopropylmalate synthase  50.51 
 
 
557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4199  2-isopropylmalate synthase  50.17 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3492  2-isopropylmalate synthase  49.32 
 
 
556 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1773  2-isopropylmalate synthase  48.99 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221893  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2373  2-isopropylmalate synthase  48.83 
 
 
567 aa  571  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1065  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 
557 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1949  2-isopropylmalate synthase  48.82 
 
 
557 aa  571  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0748  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 
562 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.534107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1444  2-isopropylmalate synthase  49.08 
 
 
585 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.413521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4594  2-isopropylmalate synthase  49.49 
 
 
559 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3548  2-isopropylmalate synthase  48.13 
 
 
556 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180442  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2267  2-isopropylmalate synthase  47.55 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1875  2-isopropylmalate synthase  48.48 
 
 
556 aa  562  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199386 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0322  2-isopropylmalate synthase  48.15 
 
 
576 aa  561  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149621  normal  0.0124022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40120  2-isopropylmalate synthase  48.65 
 
 
557 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.397785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1257  2-isopropylmalate synthase  48.58 
 
 
556 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0013  2-isopropylmalate synthase  50.26 
 
 
563 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192625  hitchhiker  0.000890742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1435  2-isopropylmalate synthase  47.8 
 
 
572 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478778  normal  0.433793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0974  2-isopropylmalate synthase  47.22 
 
 
554 aa  561  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4806  2-isopropylmalate synthase  48 
 
 
570 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394772  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1673  2-isopropylmalate synthase  47.98 
 
 
559 aa  558  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3729  2-isopropylmalate synthase  48 
 
 
570 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15030  2-isopropylmalate synthase  48.99 
 
 
592 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0403714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1323  2-isopropylmalate synthase  48.65 
 
 
556 aa  555  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2683  2-isopropylmalate synthase  47.89 
 
 
572 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0138  2-isopropylmalate synthase  48.41 
 
 
560 aa  554  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370913  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3165  2-isopropylmalate synthase  47.22 
 
 
549 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4863  2-isopropylmalate synthase  48.24 
 
 
563 aa  552  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1479  2-isopropylmalate synthase  47.57 
 
 
575 aa  555  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0183  2-isopropylmalate synthase  47.58 
 
 
565 aa  548  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.140386  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2932  2-isopropylmalate synthase  48.32 
 
 
570 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5146  2-isopropylmalate synthase  48.06 
 
 
553 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4300  2-isopropylmalate synthase  48.32 
 
 
569 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.3234 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0204  2-isopropylmalate synthase  47.14 
 
 
560 aa  548  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4981  2-isopropylmalate synthase  48.32 
 
 
570 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4250  2-isopropylmalate synthase  48.32 
 
 
570 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901664 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3179  2-isopropylmalate synthase  48.32 
 
 
570 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.1313 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2319  2-isopropylmalate synthase  46.23 
 
 
562 aa  543  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1890  2-isopropylmalate synthase  47.64 
 
 
552 aa  544  1e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0511  2-isopropylmalate synthase  46.17 
 
 
568 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2889  2-isopropylmalate synthase  48.48 
 
 
571 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00713702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0192  2-isopropylmalate synthase  47.85 
 
 
570 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2478  2-isopropylmalate synthase  46.4 
 
 
560 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148439  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0264  2-isopropylmalate synthase  47.67 
 
 
564 aa  535  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00392516  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01520  2-isopropylmalate synthase, putative  47.39 
 
 
639 aa  531  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0965657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2342  2-isopropylmalate synthase  44.46 
 
 
573 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1019  2-isopropylmalate synthase  44.59 
 
 
586 aa  530  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406917  hitchhiker  0.00437661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1461  2-isopropylmalate synthase  45.5 
 
 
556 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2024  2-isopropylmalate synthase  47.73 
 
 
557 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273488  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2298  2-isopropylmalate synthase  47.15 
 
 
553 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>