295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2710 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2710  CBS domain-containing membrane protein  100 
 
 
157 aa  310  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.828048  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3527  CBS domain-containing protein  52.6 
 
 
159 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215012  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  31.08 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  34.33 
 
 
277 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  33.09 
 
 
404 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  36.29 
 
 
361 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  29.69 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  30.23 
 
 
224 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  38.6 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3634  CBS domain-containing protein  32.64 
 
 
340 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 
211 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 
225 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 
392 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 
279 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  38.6 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 
256 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  31.47 
 
 
208 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  32.58 
 
 
136 aa  54.3  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  36 
 
 
379 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 
211 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 
232 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  27.82 
 
 
261 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  33.09 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  34.53 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.4 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
379 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  33.06 
 
 
379 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  33.06 
 
 
379 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 
221 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.39 
 
 
243 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  29.77 
 
 
282 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 
230 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  28.8 
 
 
223 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 
400 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  27.15 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  30.25 
 
 
217 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  26.76 
 
 
381 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  30.94 
 
 
383 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  43.84 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  29.93 
 
 
313 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  27.78 
 
 
242 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  27.42 
 
 
502 aa  51.2  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  29.23 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  33.87 
 
 
503 aa  50.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  30.16 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  30.22 
 
 
374 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
394 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  30.71 
 
 
226 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  35.65 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  32.5 
 
 
379 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  23.14 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  25.68 
 
 
217 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  40.68 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  26.9 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  28.99 
 
 
214 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  25.78 
 
 
309 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
885 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  30.56 
 
 
391 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  27.46 
 
 
385 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  30.33 
 
 
435 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 
216 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  28.37 
 
 
416 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 
410 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  29.73 
 
 
249 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  27.46 
 
 
385 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  28.47 
 
 
423 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  32.77 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  27.2 
 
 
214 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  27.39 
 
 
243 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  32.77 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  32.77 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  37.29 
 
 
513 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  31.78 
 
 
368 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  42.62 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  32.11 
 
 
427 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  30.38 
 
 
875 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  42.62 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 
143 aa  48.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  29.92 
 
 
226 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 
279 aa  47.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  29.37 
 
 
219 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  27.21 
 
 
242 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  30.33 
 
 
166 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  26.15 
 
 
880 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  24.82 
 
 
214 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.27 
 
 
216 aa  47.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  30.16 
 
 
909 aa  47.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  28.03 
 
 
223 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 
373 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  28.46 
 
 
238 aa  47.4  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  29.32 
 
 
152 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  28.67 
 
 
247 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  29.51 
 
 
210 aa  47.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 
376 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>