31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3634 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3634  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 340 aa  674    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3132  hypothetical protein  71.43 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2710  CBS domain-containing membrane protein  32.64 
 
 		 157 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.828048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  31.17 
 
 		 151 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 		 141 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  31.17 
 
 		 151 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  31.72 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 		 232 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  46.55 
 
 		 874 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 144 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  29.23 
 
 		 277 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 1274 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  44.83 
 
 		 872 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  27.44 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  35.96 
 
 		 209 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  30 
 
 		 907 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  25.36 
 
 		 143 aa  43.9  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  30.94 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  45.83 
 
 		 185 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  31.43 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  29.51 
 
 		 502 aa  43.5  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  31.11 
 
 		 500 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  36.84 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  28.91 
 
 		 132 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.76 
 
 		 482 aa  42.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  39.22 
 
 		 885 aa  43.1  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0186  hypothetical protein  61.76 
 
 		 82 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121753 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.76 
 
 		 482 aa  42.7  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  27.93 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.34 
 
 		 191 aa  42.7  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>