More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1313 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1313  signal peptidase I  100 
 
 		 178 aa  360  6e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  33.68 
 
 		 248 aa  84.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  33.68 
 
 		 248 aa  84.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  34.18 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  31.64 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  28.26 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.54 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  31.84 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  30.53 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  26.84 
 
 		 256 aa  74.7  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  31.29 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  26.98 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  31.43 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  29.28 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  28.42 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  28.27 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  29.28 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  32.22 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  29.28 
 
 		 220 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  29.25 
 
 		 322 aa  72  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  28.12 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  29.15 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  29.95 
 
 		 262 aa  71.2  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  28.12 
 
 		 251 aa  71.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  29.47 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  28.73 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  27.75 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  26.76 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  29.03 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  28.29 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  30.77 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  27.37 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  26.29 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  28.71 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  28.44 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  28.29 
 
 		 297 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  28.78 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1803  signal peptidase I  24.62 
 
 		 253 aa  68.2  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  29.25 
 
 		 324 aa  67.4  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  29.38 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  28.28 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  27.78 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04860  signal peptidase I, putative  29.82 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  33.33 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0184  signal peptidase I  27.63 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  25.77 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  29.27 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  33.54 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0269  signal peptidase I  24 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.081904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  28.4 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  28.5 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  27.13 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  27.08 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  28.8 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  26.42 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  27.23 
 
 		 305 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  27.13 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  28.18 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  26.52 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  26.47 
 
 		 284 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  26.79 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  31.71 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  28.43 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  26.42 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  25.12 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  27.96 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  26.52 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  27.27 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  27.27 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  28.28 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  29.52 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  29.94 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  25.26 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  29.19 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  24.31 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  26.47 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  25.47 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  30.73 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  26.04 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  26.6 
 
 		 232 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  25.47 
 
 		 297 aa  62  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  25.47 
 
 		 297 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  25.47 
 
 		 297 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  25.47 
 
 		 297 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  25.62 
 
 		 283 aa  62  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  29.79 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  26.26 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  25 
 
 		 297 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  25.94 
 
 		 322 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  26.26 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  28.88 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  28.88 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  28.88 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  28.88 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  25.94 
 
 		 322 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  28.88 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  28.88 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  24.09 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  29.08 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  25.62 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>