More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04860 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC04860  signal peptidase I, putative  100 
 
 		 235 aa  483  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38229  predicted protein  38.82 
 
 		 167 aa  98.2  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.452015 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43323  predicted protein  30.56 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  35.47 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06841  mitochondrial inner membrane protease subunit 1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12820)  29.95 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0868812  normal  0.54354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  32.35 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  33.66 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  32.34 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  29.49 
 
 		 297 aa  72  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  29.49 
 
 		 297 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  31 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  30.69 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  31.11 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  31.32 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  30 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  33.51 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  33.51 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  31.67 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  31.02 
 
 		 342 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  31.02 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  30.39 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  28.9 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  30.62 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  30.06 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4299  signal peptidase I  32.5 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  30.1 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4311  signal peptidase I  34.17 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4289  signal peptidase I  34.17 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  30.09 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  30 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  26.73 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  28.11 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4158  signal peptidase I  34.17 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  31.72 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1313  signal peptidase I  31.1 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  29.58 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  31.25 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  30.5 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  28.11 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  31.68 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  28.11 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  28.11 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  28.11 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  31.49 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  28.11 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  28.11 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  30.14 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  31.37 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  33.66 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36969  predicted protein  41.12 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  29.11 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  29.63 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  32.46 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  31.21 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  30.81 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  30.36 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  32.93 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  31.82 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  29.63 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  30.82 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  30 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  30.61 
 
 		 186 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  31.9 
 
 		 264 aa  62  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  31.32 
 
 		 174 aa  62  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1525  signal peptidase I  31.02 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04140  peptidase, putative  27.68 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0270434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  30.77 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  32.21 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  28.57 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  28.57 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  28.57 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  28.57 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  28.57 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  29.76 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  28.57 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  29.68 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  29.6 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  27.85 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  28.57 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  30.93 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  28.9 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  29.65 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  32.68 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  27.23 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  27.87 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  29.24 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  29.41 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  30.5 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  29.8 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  27.85 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  27.45 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  32.65 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  29.15 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  27.01 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  27.01 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  26.61 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  29.78 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  31.74 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  27.68 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  27.68 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>