181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43323 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_43323  predicted protein  100 
 
 
183 aa  386  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal  0.450522 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06841  mitochondrial inner membrane protease subunit 1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12820)  39.29 
 
 
182 aa  95.1  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0868812  normal  0.54354 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04860  signal peptidase I, putative  30.56 
 
 
235 aa  87  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38229  predicted protein  30.36 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.452015 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03149  mitochondrial inner membrane protease subunit Imp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13840)  27.91 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.352834  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36969  predicted protein  38.46 
 
 
223 aa  62.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  32.64 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  30.49 
 
 
217 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  30.56 
 
 
184 aa  61.2  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  30.46 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  31.29 
 
 
198 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  25.62 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  28.93 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0073  signal peptidase I  24.39 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  31.21 
 
 
189 aa  55.1  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  27.6 
 
 
274 aa  54.7  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  26.83 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  28.29 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  36.78 
 
 
290 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  29.41 
 
 
189 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10934  predicted protein  29.13 
 
 
112 aa  52.4  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.796022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  30.38 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  25.64 
 
 
322 aa  51.6  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  28.66 
 
 
183 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2135  signal peptidase I  30.32 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0591499  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  25.64 
 
 
322 aa  51.2  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  27.95 
 
 
200 aa  50.8  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04140  peptidase, putative  27.46 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0270434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  26.7 
 
 
263 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  28.85 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  26.51 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  27.39 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  28.77 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  28.77 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  29.77 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  33.68 
 
 
304 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  27.87 
 
 
221 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  28.1 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  25.15 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  27.56 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  31.06 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  25.56 
 
 
267 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  30.4 
 
 
290 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  26.34 
 
 
286 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  28.07 
 
 
219 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  34.62 
 
 
268 aa  48.9  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  27.1 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  27.04 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  29.45 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  31.06 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  26.8 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  30 
 
 
197 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  31.08 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  27.45 
 
 
187 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  31.25 
 
 
187 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  32.31 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  27.45 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  27.45 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  27.45 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  25.69 
 
 
192 aa  47.8  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  27.45 
 
 
187 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  26.8 
 
 
187 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2801  signal peptidase I  31.15 
 
 
173 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241718  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  28 
 
 
192 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  28 
 
 
193 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  30.71 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  27.64 
 
 
189 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  30.39 
 
 
251 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  27.59 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3111  signal peptidase I  31.15 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.349413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  26 
 
 
262 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3112  Signal peptidase I  31.15 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  26.8 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2871  Signal peptidase I  31.15 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2841  signal peptidase I  31.15 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000384139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  24.58 
 
 
270 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  26.8 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3086  Signal peptidase I  31.15 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  23.35 
 
 
248 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  23.35 
 
 
248 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3092  signal peptidase I  31.15 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  26.8 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  29.57 
 
 
288 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  26.58 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  30 
 
 
254 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  34 
 
 
248 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  30.36 
 
 
222 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  25.79 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  29.45 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  26.32 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  25.4 
 
 
288 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  26.51 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  24.47 
 
 
247 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3079  signal peptidase I  31.15 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  25.13 
 
 
260 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  31.67 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2156  signal peptidase I  31.15 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  25.95 
 
 
199 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  24.24 
 
 
298 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  29.33 
 
 
209 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>