45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_36969 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_36969  predicted protein  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06841  mitochondrial inner membrane protease subunit 1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12820)  45.68 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0868812  normal  0.54354 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04860  signal peptidase I, putative  30.81 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38229  predicted protein  29.41 
 
 
167 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.452015 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43323  predicted protein  27.36 
 
 
183 aa  64.7  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal  0.450522 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03149  mitochondrial inner membrane protease subunit Imp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13840)  27.18 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.352834  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10934  predicted protein  40 
 
 
112 aa  56.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.796022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  26.45 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  34.23 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  36.36 
 
 
176 aa  49.3  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  26.87 
 
 
188 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  39.22 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  29.25 
 
 
189 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  33.01 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  33.91 
 
 
174 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  37.36 
 
 
171 aa  46.6  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  36.63 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  33.86 
 
 
179 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04140  peptidase, putative  34.12 
 
 
187 aa  45.4  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0270434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  30.48 
 
 
188 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  28.7 
 
 
219 aa  45.1  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  30.28 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  28.79 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  28.1 
 
 
288 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  30.94 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0432  signal peptidase I  29.41 
 
 
180 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0849039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  29.52 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  29.52 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  29.52 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  30.21 
 
 
189 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  25.79 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  30.48 
 
 
187 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2135  signal peptidase I  35.44 
 
 
194 aa  42.4  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0591499  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  43.48 
 
 
380 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  37.97 
 
 
185 aa  42.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  32.14 
 
 
283 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2560  hypothetical protein  52.54 
 
 
151 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  29.52 
 
 
187 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  25.75 
 
 
236 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  29.52 
 
 
187 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  37.14 
 
 
304 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  43.4 
 
 
324 aa  42  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  32.11 
 
 
262 aa  41.6  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  25.69 
 
 
248 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  33.33 
 
 
263 aa  41.6  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>