More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13007 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  74.38 
 
 
504 aa  721    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
490 aa  987    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  78.66 
 
 
491 aa  767    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  73.25 
 
 
494 aa  713    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  77.41 
 
 
490 aa  758    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  77.41 
 
 
490 aa  758    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  78.51 
 
 
495 aa  772    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  77.41 
 
 
490 aa  759    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  64.44 
 
 
493 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 
501 aa  617  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  63.45 
 
 
509 aa  615  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  63.19 
 
 
504 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  65.16 
 
 
496 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  60.9 
 
 
492 aa  604  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  64.45 
 
 
499 aa  601  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 
505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  59.8 
 
 
509 aa  596  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
503 aa  595  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  63.6 
 
 
501 aa  595  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  62.47 
 
 
512 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
504 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 
532 aa  580  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 
506 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  55.69 
 
 
517 aa  559  1e-158  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  62.89 
 
 
525 aa  560  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 
491 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 
494 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
504 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
498 aa  339  5e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
490 aa  339  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
494 aa  336  7e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
488 aa  335  1e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
469 aa  335  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
469 aa  332  8e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
455 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
496 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
469 aa  328  9e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
504 aa  326  5e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.11 
 
 
495 aa  326  5e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
487 aa  326  8.000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
500 aa  325  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
477 aa  323  6e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
485 aa  319  6e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
486 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
490 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
468 aa  317  2e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
480 aa  315  9e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
492 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
473 aa  311  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
488 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
466 aa  312  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
491 aa  312  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
468 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
503 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
455 aa  310  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
506 aa  310  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
507 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
501 aa  307  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
485 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
477 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
479 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
535 aa  304  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
491 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
466 aa  302  7.000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 
484 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
488 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
505 aa  301  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
493 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
512 aa  300  3e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
481 aa  300  3e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
466 aa  299  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
466 aa  299  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
465 aa  299  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
468 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 
467 aa  298  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
493 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
488 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
503 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
463 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
505 aa  296  7e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
491 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
467 aa  296  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>