More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1261 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 
499 aa  642    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  84.33 
 
 
517 aa  895    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
506 aa  1031    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 
505 aa  674    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  64.59 
 
 
503 aa  647    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  63.6 
 
 
504 aa  640    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  64.84 
 
 
509 aa  663    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 
501 aa  631  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  61.38 
 
 
509 aa  629  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 
504 aa  627  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 
501 aa  588  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  61.15 
 
 
493 aa  588  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 
525 aa  588  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  59.08 
 
 
504 aa  578  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 
496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 
494 aa  569  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 
532 aa  569  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 
491 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 
490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 
490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
495 aa  559  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
490 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
492 aa  554  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 
491 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 
512 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
490 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
494 aa  485  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
485 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
504 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
496 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
505 aa  317  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
500 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
488 aa  313  4.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
506 aa  312  7.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
498 aa  312  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
485 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
478 aa  311  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
485 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
487 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
484 aa  311  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
504 aa  311  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
509 aa  310  4e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
493 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
501 aa  307  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 
477 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
490 aa  306  7e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
503 aa  305  9.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  35.79 
 
 
495 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
490 aa  303  5.000000000000001e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
509 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
469 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
491 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
484 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
469 aa  300  5e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
488 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 
486 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
491 aa  299  7e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
468 aa  299  8e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
506 aa  299  9e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
488 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
473 aa  297  3e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 
495 aa  296  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
504 aa  295  9e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
491 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
469 aa  295  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 
485 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
484 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
464 aa  294  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
479 aa  294  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
467 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
488 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
464 aa  291  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
491 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
455 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
484 aa  289  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
481 aa  288  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
491 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 
485 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
485 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
485 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
485 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
485 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
485 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
506 aa  286  8e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
495 aa  283  6.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
514 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
485 aa  283  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
469 aa  283  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
462 aa  282  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  33 
 
 
484 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>