More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0944 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 464 aa  953    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  97.63 
 
 		 464 aa  934    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  59.44 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 467 aa  578  1e-164  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0592  glutamyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  45.25 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 469 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 501 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 482 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 487 aa  385  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 492 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 488 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 485 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 473 aa  366  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 463 aa  364  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 498 aa  364  2e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 504 aa  360  2e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 486 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 491 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 471 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 492 aa  349  7e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 490 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 506 aa  347  4e-94  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 500 aa  346  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 468 aa  346  6e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 495 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 499 aa  344  2e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 490 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 479 aa  343  4e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 481 aa  342  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 465 aa  339  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1080  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 466 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 467 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 491 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 464 aa  335  9e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 492 aa  335  9e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 535 aa  333  4e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 474 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 474 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 463 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 489 aa  330  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 474 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 467 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 485 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 485 aa  329  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 466 aa  329  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 466 aa  329  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 467 aa  328  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 470 aa  327  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 470 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 504 aa  327  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 504 aa  327  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 491 aa  326  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 464 aa  326  6e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 471 aa  326  7e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  39.54 
 
 		 546 aa  325  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 463 aa  324  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 493 aa  322  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 506 aa  322  9.000000000000001e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 475 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 463 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 468 aa  320  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>