More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2320 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 507 aa  1025    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  71.14 
 
 		 503 aa  726    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  91.12 
 
 		 506 aa  926    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 495 aa  448  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 487 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 484 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 500 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 490 aa  397  1e-109  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 496 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 501 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 479 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 493 aa  364  2e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  40.82 
 
 		 495 aa  364  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 482 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 480 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 504 aa  360  4e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 491 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 516 aa  353  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 491 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 491 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 501 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 512 aa  347  4e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 466 aa  346  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 502 aa  346  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 476 aa  346  6e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 505 aa  346  6e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 494 aa  345  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 493 aa  345  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 493 aa  343  5.999999999999999e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 485 aa  342  8e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 495 aa  341  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 509 aa  341  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 502 aa  341  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 509 aa  339  8e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 502 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 491 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 504 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 489 aa  336  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 503 aa  336  5.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 510 aa  336  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 465 aa  335  9e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 468 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 493 aa  335  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 469 aa  335  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 498 aa  333  3e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 504 aa  333  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 469 aa  333  5e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 509 aa  333  6e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 535 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 492 aa  331  2e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 473 aa  330  4e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 503 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 500 aa  330  5.0000000000000004e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 481 aa  329  9e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 504 aa  329  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 501 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 503 aa  326  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 506 aa  326  6e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 494 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 467 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 493 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 493 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 470 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 494 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 499 aa  323  6e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 490 aa  323  6e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>