More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2057 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  60.94 
 
 		 493 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  62.19 
 
 		 493 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  83.53 
 
 		 505 aa  868    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  63.02 
 
 		 493 aa  653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 509 aa  1061    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 		 514 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 493 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  61.15 
 
 		 493 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 		 494 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  61.84 
 
 		 493 aa  648    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  95.68 
 
 		 509 aa  998    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 		 494 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  62.24 
 
 		 493 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  61.15 
 
 		 493 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  61.35 
 
 		 493 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 493 aa  622  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 		 503 aa  614  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 494 aa  613  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 485 aa  512  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 484 aa  508  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 484 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 488 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 489 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 504 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 492 aa  402  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 504 aa  398  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 494 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 484 aa  361  1e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 480 aa  359  7e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 495 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 487 aa  356  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 490 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 482 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 479 aa  346  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 470 aa  345  8e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 486 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 507 aa  342  7e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.31 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 485 aa  339  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 477 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 509 aa  336  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 506 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 502 aa  335  9e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 495 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 490 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 504 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 516 aa  332  8e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 502 aa  332  9e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 502 aa  332  9e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 489 aa  331  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 471 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 503 aa  329  9e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 494 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 502 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 493 aa  326  5e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 491 aa  326  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 469 aa  325  8.000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 484 aa  325  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 485 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 480 aa  324  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 491 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 493 aa  319  7e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 484 aa  319  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 472 aa  319  7e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 484 aa  319  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 467 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 517 aa  318  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 468 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>