More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0757 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 495 aa  1006    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 487 aa  425  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 484 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 484 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 492 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 490 aa  395  1e-109  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 500 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 496 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 476 aa  363  4e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 505 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 501 aa  352  7e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 469 aa  352  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 492 aa  351  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 477 aa  350  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 491 aa  350  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 485 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 493 aa  348  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 490 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 509 aa  341  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 514 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 493 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 501 aa  336  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 503 aa  335  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 495 aa  334  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 466 aa  334  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 488 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 493 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 494 aa  333  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 493 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 504 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 479 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 473 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 504 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 500 aa  330  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 468 aa  330  4e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 493 aa  329  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 501 aa  328  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 502 aa  327  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 504 aa  326  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 493 aa  326  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 474 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 472 aa  325  9e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 509 aa  323  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 504 aa  323  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 499 aa  322  7e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 464 aa  322  8e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 496 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 471 aa  319  6e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 493 aa  318  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 474 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 509 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 491 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 502 aa  317  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 466 aa  316  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 466 aa  316  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 484 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 485 aa  316  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 503 aa  315  9e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.88 
 
 		 495 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2659  glutamyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 517 aa  314  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 475 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 474 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 503 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>