More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2842 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  71.28 
 
 		 474 aa  677    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  70.06 
 
 		 474 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  91.75 
 
 		 473 aa  889    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 473 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  67.09 
 
 		 473 aa  653    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  71 
 
 		 471 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 		 474 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  69.43 
 
 		 474 aa  665    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  70.13 
 
 		 475 aa  679    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  71.91 
 
 		 474 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  82.24 
 
 		 496 aa  809    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  95.77 
 
 		 473 aa  902    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  69.98 
 
 		 474 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  82.24 
 
 		 474 aa  815    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 473 aa  959    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  82.45 
 
 		 491 aa  807    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  65.82 
 
 		 473 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  66.1 
 
 		 475 aa  648    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  67.58 
 
 		 473 aa  660    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  71.91 
 
 		 474 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  69.56 
 
 		 473 aa  652    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  61.24 
 
 		 476 aa  610  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  62 
 
 		 490 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 474 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  60.52 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 466 aa  548  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 		 471 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 471 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 466 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  57.05 
 
 		 487 aa  521  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 		 490 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 474 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 473 aa  434  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 471 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 466 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 466 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 466 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 475 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 504 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 467 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 475 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>