More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1645 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 		 474 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  76.01 
 
 		 473 aa  753    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  66.24 
 
 		 474 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  66.1 
 
 		 475 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  67.3 
 
 		 474 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  74.52 
 
 		 473 aa  750    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  64.97 
 
 		 496 aa  634    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  67.23 
 
 		 474 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  68.01 
 
 		 473 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  66.6 
 
 		 474 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 		 473 aa  650    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  67.09 
 
 		 474 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  67.73 
 
 		 474 aa  642    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 475 aa  967    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  76.43 
 
 		 473 aa  758    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  66.53 
 
 		 473 aa  645    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  69.02 
 
 		 471 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  67.45 
 
 		 476 aa  678    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  67.16 
 
 		 473 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 490 aa  628  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 474 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  66.1 
 
 		 473 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 491 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  63.89 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 466 aa  557  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 487 aa  539  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 		 471 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 471 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 471 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 466 aa  521  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 490 aa  513  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 470 aa  493  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 465 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 474 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 471 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 470 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 469 aa  415  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 464 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 479 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 477 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 480 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 466 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 471 aa  392  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  44.52 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>