More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2786 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 474 aa  959    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 490 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 474 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 471 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 474 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 474 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 479 aa  478  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 475 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 474 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 468 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 474 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 476 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 491 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 474 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 487 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 		 468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 475 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 		 466 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 473 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 470 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 466 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 473 aa  403  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 472 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 467 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 471 aa  385  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 468 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 470 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2140  glutamyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000804672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 473 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 467 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 471 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 469 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 471 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1022  glutamyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000173341  normal  0.120232 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 480 aa  366  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1114  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00321012  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1209  glutamyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 512 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 464 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 504 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 472 aa  363  3e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2028  glutamyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 467 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 504 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 504 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 469 aa  362  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 469 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 469 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 469 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 469 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 469 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 469 aa  362  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 469 aa  362  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 470 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>