More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4681 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  71.76 
 
 		 473 aa  678    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 473 aa  662    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  69.7 
 
 		 473 aa  670    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  71.55 
 
 		 474 aa  670    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  79.32 
 
 		 474 aa  750    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  80.17 
 
 		 474 aa  756    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 474 aa  942    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  68.79 
 
 		 496 aa  661    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  71.13 
 
 		 473 aa  655    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  98.95 
 
 		 474 aa  933    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  69.64 
 
 		 474 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  69.43 
 
 		 473 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  69.64 
 
 		 491 aa  663    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  71.88 
 
 		 473 aa  680    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  72.92 
 
 		 471 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  83.72 
 
 		 475 aa  801    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  67.73 
 
 		 475 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  96.2 
 
 		 474 aa  913    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  80.6 
 
 		 474 aa  758    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  70.13 
 
 		 473 aa  676    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  71.76 
 
 		 473 aa  665    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 		 476 aa  622  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  64.03 
 
 		 490 aa  605  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  63.54 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  62.55 
 
 		 468 aa  559  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 466 aa  538  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 466 aa  518  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 487 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  57.57 
 
 		 471 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 468 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 490 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 472 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 470 aa  438  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 469 aa  422  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 475 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 472 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 469 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 466 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 480 aa  400  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 469 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>