More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0705 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  72.41 
 
 		 471 aa  663    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 471 aa  958    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  99.15 
 
 		 471 aa  951    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  92.36 
 
 		 471 aa  869    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  67.87 
 
 		 470 aa  662    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  75.05 
 
 		 466 aa  725    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  71.06 
 
 		 468 aa  675    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 		 473 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  58.03 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  57.05 
 
 		 473 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 475 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 		 473 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 		 473 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 490 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 491 aa  528  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 474 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 474 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 		 473 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 		 471 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 474 aa  521  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 473 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 474 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 474 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 473 aa  504  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 490 aa  498  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 468 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 479 aa  487  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 473 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 466 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 466 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 465 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 470 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 463 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 469 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 468 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  40.56 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 469 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 469 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 469 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 469 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 469 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 469 aa  365  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 469 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 471 aa  364  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 471 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 469 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 475 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 459 aa  363  4e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>